Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HNF4GQ14541 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HNF4GQ14541 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HNF4GQ14541 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HNF4GQ14541 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HNF4GQ14541 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HNF4GQ14541 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HNF4GQ14541 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HNF4GQ14541 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HNF4GQ14541 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HNF4GQ14541 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HNF4GQ14541 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HNF4GQ14541 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HNF4GQ14541 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HNF4GQ14541 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HNF4GQ14541 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HNF4GQ14541 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HNF4GQ14541 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HNF4GQ14541 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HNF4GQ14541 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HNF4GQ14541 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HNF4GQ14541 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HNF4GQ14541 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HNF4GQ14541 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HNF4GQ14541 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HNF4GQ14541 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HNF4GQ14541 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HNF4GQ14541 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HNF4GQ14541 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HNF4GQ14541 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
HNF4GQ14541 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HNF4GQ14541 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HNF4GQ14541 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HNF4GQ14541 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HNF4GQ14541 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HNF4GQ14541 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HNF4GQ14541 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HNF4GQ14541 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HNF4GQ14541 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HNF4GQ14541 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HNF4GQ14541 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HNF4GQ14541 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HNF4GQ14541 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HNF4GQ14541 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HNF4GQ14541 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HNF4GQ14541 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HNF4GQ14541 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HNF4GQ14541 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HNF4GQ14541 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HNF4GQ14541 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HNF4GQ14541 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HNF4GQ14541 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HNF4GQ14541 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HNF4GQ14541 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HNF4GQ14541 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HNF4GQ14541 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HNF4GQ14541 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HNF4GQ14541 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HNF4GQ14541 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HNF4GQ14541 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HNF4GQ14541 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HNF4GQ14541 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HNF4GQ14541 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HNF4GQ14541 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HNF4GQ14541 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HNF4GQ14541 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HNF4GQ14541 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HNF4GQ14541 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HNF4GQ14541 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HNF4GQ14541 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HNF4GQ14541 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HNF4GQ14541 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HNF4GQ14541 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HNF4GQ14541 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HNF4GQ14541 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HNF4GQ14541 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HNF4GQ14541 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HNF4GQ14541 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HNF4GQ14541 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HNF4GQ14541 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HNF4GQ14541 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HNF4GQ14541 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HNF4GQ14541 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HNF4GQ14541 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HNF4GQ14541 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HNF4GQ14541 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HNF4GQ14541 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HNF4GQ14541 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HNF4GQ14541 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HNF4GQ14541 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HNF4GQ14541 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HNF4GQ14541 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HNF4GQ14541 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HNF4GQ14541 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HNF4GQ14541 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HNF4GQ14541 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HNF4GQ14541 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HNF4GQ14541 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HNF4GQ14541 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HNF4GQ14541 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms