Protein–RNA interactions for Protein: Q13905

RAPGEF1, Rap guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,077 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF1Q13905 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAPGEF1Q13905 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
RAPGEF1Q13905 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RAPGEF1Q13905 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAPGEF1Q13905 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAPGEF1Q13905 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAPGEF1Q13905 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAPGEF1Q13905 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAPGEF1Q13905 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAPGEF1Q13905 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAPGEF1Q13905 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAPGEF1Q13905 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAPGEF1Q13905 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAPGEF1Q13905 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAPGEF1Q13905 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAPGEF1Q13905 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAPGEF1Q13905 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAPGEF1Q13905 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAPGEF1Q13905 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAPGEF1Q13905 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAPGEF1Q13905 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAPGEF1Q13905 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAPGEF1Q13905 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAPGEF1Q13905 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAPGEF1Q13905 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAPGEF1Q13905 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAPGEF1Q13905 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAPGEF1Q13905 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAPGEF1Q13905 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAPGEF1Q13905 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAPGEF1Q13905 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAPGEF1Q13905 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAPGEF1Q13905 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAPGEF1Q13905 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAPGEF1Q13905 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAPGEF1Q13905 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
RAPGEF1Q13905 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAPGEF1Q13905 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAPGEF1Q13905 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAPGEF1Q13905 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAPGEF1Q13905 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAPGEF1Q13905 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAPGEF1Q13905 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAPGEF1Q13905 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAPGEF1Q13905 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
RAPGEF1Q13905 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAPGEF1Q13905 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAPGEF1Q13905 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAPGEF1Q13905 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAPGEF1Q13905 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAPGEF1Q13905 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAPGEF1Q13905 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAPGEF1Q13905 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAPGEF1Q13905 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAPGEF1Q13905 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
RAPGEF1Q13905 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAPGEF1Q13905 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAPGEF1Q13905 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAPGEF1Q13905 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAPGEF1Q13905 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAPGEF1Q13905 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAPGEF1Q13905 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAPGEF1Q13905 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAPGEF1Q13905 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAPGEF1Q13905 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAPGEF1Q13905 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAPGEF1Q13905 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAPGEF1Q13905 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RAPGEF1Q13905 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAPGEF1Q13905 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAPGEF1Q13905 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAPGEF1Q13905 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAPGEF1Q13905 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAPGEF1Q13905 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAPGEF1Q13905 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAPGEF1Q13905 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAPGEF1Q13905 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAPGEF1Q13905 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAPGEF1Q13905 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAPGEF1Q13905 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAPGEF1Q13905 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAPGEF1Q13905 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAPGEF1Q13905 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAPGEF1Q13905 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAPGEF1Q13905 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAPGEF1Q13905 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAPGEF1Q13905 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAPGEF1Q13905 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAPGEF1Q13905 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAPGEF1Q13905 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAPGEF1Q13905 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAPGEF1Q13905 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAPGEF1Q13905 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAPGEF1Q13905 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAPGEF1Q13905 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAPGEF1Q13905 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAPGEF1Q13905 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAPGEF1Q13905 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAPGEF1Q13905 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAPGEF1Q13905 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 429.4 ms