Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC2Q13868 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC2Q13868 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC2Q13868 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC2Q13868 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC2Q13868 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC2Q13868 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC2Q13868 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC2Q13868 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC2Q13868 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC2Q13868 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC2Q13868 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC2Q13868 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC2Q13868 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC2Q13868 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC2Q13868 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EXOSC2Q13868 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EXOSC2Q13868 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EXOSC2Q13868 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EXOSC2Q13868 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EXOSC2Q13868 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EXOSC2Q13868 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EXOSC2Q13868 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EXOSC2Q13868 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC2Q13868 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC2Q13868 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC2Q13868 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC2Q13868 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC2Q13868 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC2Q13868 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC2Q13868 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC2Q13868 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC2Q13868 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC2Q13868 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC2Q13868 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC2Q13868 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
EXOSC2Q13868 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
EXOSC2Q13868 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EXOSC2Q13868 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EXOSC2Q13868 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EXOSC2Q13868 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EXOSC2Q13868 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EXOSC2Q13868 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EXOSC2Q13868 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC2Q13868 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC2Q13868 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC2Q13868 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC2Q13868 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC2Q13868 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC2Q13868 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC2Q13868 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXOSC2Q13868 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXOSC2Q13868 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXOSC2Q13868 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXOSC2Q13868 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXOSC2Q13868 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXOSC2Q13868 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXOSC2Q13868 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXOSC2Q13868 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXOSC2Q13868 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXOSC2Q13868 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXOSC2Q13868 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EXOSC2Q13868 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EXOSC2Q13868 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EXOSC2Q13868 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EXOSC2Q13868 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EXOSC2Q13868 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EXOSC2Q13868 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EXOSC2Q13868 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EXOSC2Q13868 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXOSC2Q13868 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXOSC2Q13868 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXOSC2Q13868 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXOSC2Q13868 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXOSC2Q13868 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXOSC2Q13868 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EXOSC2Q13868 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EXOSC2Q13868 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EXOSC2Q13868 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EXOSC2Q13868 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EXOSC2Q13868 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EXOSC2Q13868 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EXOSC2Q13868 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EXOSC2Q13868 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EXOSC2Q13868 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
EXOSC2Q13868 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EXOSC2Q13868 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EXOSC2Q13868 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EXOSC2Q13868 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EXOSC2Q13868 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EXOSC2Q13868 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EXOSC2Q13868 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EXOSC2Q13868 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EXOSC2Q13868 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EXOSC2Q13868 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EXOSC2Q13868 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
EXOSC2Q13868 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EXOSC2Q13868 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
EXOSC2Q13868 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EXOSC2Q13868 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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