Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
DNASE1L3Q13609 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNASE1L3Q13609 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNASE1L3Q13609 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNASE1L3Q13609 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNASE1L3Q13609 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNASE1L3Q13609 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNASE1L3Q13609 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNASE1L3Q13609 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNASE1L3Q13609 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNASE1L3Q13609 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNASE1L3Q13609 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNASE1L3Q13609 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNASE1L3Q13609 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNASE1L3Q13609 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNASE1L3Q13609 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNASE1L3Q13609 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNASE1L3Q13609 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNASE1L3Q13609 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNASE1L3Q13609 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNASE1L3Q13609 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNASE1L3Q13609 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNASE1L3Q13609 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNASE1L3Q13609 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNASE1L3Q13609 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DNASE1L3Q13609 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNASE1L3Q13609 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNASE1L3Q13609 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNASE1L3Q13609 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNASE1L3Q13609 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNASE1L3Q13609 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DNASE1L3Q13609 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNASE1L3Q13609 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNASE1L3Q13609 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNASE1L3Q13609 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNASE1L3Q13609 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNASE1L3Q13609 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DNASE1L3Q13609 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNASE1L3Q13609 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNASE1L3Q13609 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DNASE1L3Q13609 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNASE1L3Q13609 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNASE1L3Q13609 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNASE1L3Q13609 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNASE1L3Q13609 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNASE1L3Q13609 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNASE1L3Q13609 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNASE1L3Q13609 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNASE1L3Q13609 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNASE1L3Q13609 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNASE1L3Q13609 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNASE1L3Q13609 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNASE1L3Q13609 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNASE1L3Q13609 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNASE1L3Q13609 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNASE1L3Q13609 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNASE1L3Q13609 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNASE1L3Q13609 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNASE1L3Q13609 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNASE1L3Q13609 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNASE1L3Q13609 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNASE1L3Q13609 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNASE1L3Q13609 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNASE1L3Q13609 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNASE1L3Q13609 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNASE1L3Q13609 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNASE1L3Q13609 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNASE1L3Q13609 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNASE1L3Q13609 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DNASE1L3Q13609 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNASE1L3Q13609 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DNASE1L3Q13609 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNASE1L3Q13609 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNASE1L3Q13609 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNASE1L3Q13609 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNASE1L3Q13609 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNASE1L3Q13609 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNASE1L3Q13609 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNASE1L3Q13609 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNASE1L3Q13609 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNASE1L3Q13609 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNASE1L3Q13609 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNASE1L3Q13609 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNASE1L3Q13609 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNASE1L3Q13609 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNASE1L3Q13609 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNASE1L3Q13609 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNASE1L3Q13609 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNASE1L3Q13609 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNASE1L3Q13609 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DNASE1L3Q13609 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNASE1L3Q13609 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNASE1L3Q13609 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNASE1L3Q13609 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNASE1L3Q13609 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNASE1L3Q13609 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNASE1L3Q13609 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNASE1L3Q13609 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNASE1L3Q13609 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNASE1L3Q13609 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
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