Protein–RNA interactions for Protein: Q13596

SNX1, Sorting nexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1Q13596 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX1Q13596 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX1Q13596 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX1Q13596 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX1Q13596 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX1Q13596 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX1Q13596 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX1Q13596 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX1Q13596 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX1Q13596 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX1Q13596 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX1Q13596 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX1Q13596 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX1Q13596 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX1Q13596 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX1Q13596 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX1Q13596 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX1Q13596 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX1Q13596 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX1Q13596 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX1Q13596 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX1Q13596 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX1Q13596 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX1Q13596 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX1Q13596 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX1Q13596 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SNX1Q13596 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX1Q13596 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX1Q13596 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX1Q13596 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX1Q13596 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX1Q13596 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX1Q13596 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX1Q13596 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX1Q13596 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX1Q13596 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX1Q13596 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX1Q13596 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX1Q13596 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX1Q13596 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX1Q13596 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX1Q13596 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX1Q13596 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX1Q13596 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX1Q13596 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX1Q13596 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX1Q13596 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX1Q13596 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX1Q13596 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX1Q13596 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX1Q13596 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX1Q13596 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX1Q13596 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX1Q13596 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX1Q13596 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX1Q13596 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX1Q13596 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX1Q13596 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX1Q13596 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX1Q13596 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX1Q13596 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNX1Q13596 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNX1Q13596 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNX1Q13596 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNX1Q13596 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNX1Q13596 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNX1Q13596 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNX1Q13596 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNX1Q13596 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX1Q13596 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX1Q13596 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX1Q13596 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX1Q13596 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX1Q13596 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX1Q13596 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX1Q13596 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX1Q13596 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX1Q13596 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX1Q13596 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX1Q13596 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX1Q13596 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX1Q13596 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX1Q13596 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX1Q13596 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX1Q13596 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX1Q13596 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX1Q13596 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX1Q13596 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX1Q13596 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX1Q13596 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX1Q13596 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX1Q13596 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX1Q13596 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX1Q13596 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX1Q13596 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX1Q13596 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX1Q13596 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX1Q13596 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX1Q13596 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX1Q13596 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
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