Protein–RNA interactions for Protein: Q12316

TY1B-GR3, Transposon Ty1-GR3 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-GR3Q12316 YDL057WYDL057W 987 nt9.68□□□□□ -0.86
TY1B-GR3Q12316 EFM4YIL064W 774 nt9.68□□□□□ -0.86
TY1B-GR3Q12316 CIN4YMR138W 576 nt9.68□□□□□ -0.86
TY1B-GR3Q12316 SNT309YPR101W 528 nt9.67□□□□□ -0.86
TY1B-GR3Q12316 OPI11YPR044C 354 nt9.66□□□□□ -0.86
TY1B-GR3Q12316 QCR6YFR033C 444 nt9.65□□□□□ -0.86
TY1B-GR3Q12316 FRE5YOR384W 2085 nt9.65□□□□□ -0.86
TY1B-GR3Q12316 RMD8YFR048W 1989 nt9.65□□□□□ -0.86
TY1B-GR3Q12316 ADE17YMR120C 1779 nt9.65□□□□□ -0.86
TY1B-GR3Q12316 YGL036WYGL036W 2730 nt9.65□□□□□ -0.87
TY1B-GR3Q12316 UGX2YDL169C 672 nt9.64□□□□□ -0.87
TY1B-GR3Q12316 MRPL22YNL177C 930 nt9.64□□□□□ -0.87
TY1B-GR3Q12316 AAD15YOL165C 432 nt9.64□□□□□ -0.87
TY1B-GR3Q12316 YJL045WYJL045W 1905 nt9.64□□□□□ -0.87
TY1B-GR3Q12316 ENB1YOL158C 1821 nt9.64□□□□□ -0.87
TY1B-GR3Q12316 PXL1YKR090W 2121 nt9.63□□□□□ -0.87
TY1B-GR3Q12316 IRC11YOR013W 471 nt9.63□□□□□ -0.87
TY1B-GR3Q12316 TPO3YPR156C 1869 nt9.63□□□□□ -0.87
TY1B-GR3Q12316 PYK2YOR347C 1521 nt9.63□□□□□ -0.87
TY1B-GR3Q12316 ATG12YBR217W 561 nt9.63□□□□□ -0.87
TY1B-GR3Q12316 YGR022CYGR022C 330 nt9.62□□□□□ -0.87
TY1B-GR3Q12316 YLR283WYLR283W 945 nt9.62□□□□□ -0.87
TY1B-GR3Q12316 CAN1YEL063C 1773 nt9.61□□□□□ -0.87
TY1B-GR3Q12316 RIX7YLL034C 2514 nt9.61□□□□□ -0.87
TY1B-GR3Q12316 COR1YBL045C 1374 nt9.61□□□□□ -0.87
TY1B-GR3Q12316 LST8YNL006W 912 nt9.61□□□□□ -0.87
TY1B-GR3Q12316 MET30YIL046W 1923 nt9.61□□□□□ -0.87
TY1B-GR3Q12316 YKR018CYKR018C 2178 nt9.61□□□□□ -0.87
TY1B-GR3Q12316 YTP1YNL237W 1380 nt9.6□□□□□ -0.87
TY1B-GR3Q12316 HEM1YDR232W 1647 nt9.6□□□□□ -0.87
TY1B-GR3Q12316 MRK1YDL079C 1506 nt9.6□□□□□ -0.87
TY1B-GR3Q12316 YDL129WYDL129W 876 nt9.6□□□□□ -0.87
TY1B-GR3Q12316 YLR194CYLR194C 765 nt9.6□□□□□ -0.87
TY1B-GR3Q12316 RDN5-2RDN5-2 119 nt9.59□□□□□ -0.87
TY1B-GR3Q12316 RDN5-3RDN5-3 119 nt9.59□□□□□ -0.87
TY1B-GR3Q12316 RDN5-4RDN5-4 119 nt9.59□□□□□ -0.87
TY1B-GR3Q12316 RDN5-5RDN5-5 119 nt9.59□□□□□ -0.87
TY1B-GR3Q12316 SNO4YMR322C 714 nt9.59□□□□□ -0.87
TY1B-GR3Q12316 HSP33YOR391C 714 nt9.59□□□□□ -0.87
TY1B-GR3Q12316 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt9.59□□□□□ -0.87
TY1B-GR3Q12316 HSP32YPL280W 714 nt9.59□□□□□ -0.87
TY1B-GR3Q12316 ECM31YBR176W 939 nt9.59□□□□□ -0.87
TY1B-GR3Q12316 PUF3YLL013C 2640 nt9.59□□□□□ -0.87
TY1B-GR3Q12316 TEA1YOR337W 2280 nt9.59□□□□□ -0.88
TY1B-GR3Q12316 PHB1YGR132C 864 nt9.58□□□□□ -0.88
TY1B-GR3Q12316 PSY4YBL046W 1326 nt9.58□□□□□ -0.88
TY1B-GR3Q12316 PKC1YBL105C 3456 nt9.57□□□□□ -0.88
TY1B-GR3Q12316 AFG1YEL052W 1530 nt9.57□□□□□ -0.88
TY1B-GR3Q12316 MSY1YPL097W 1479 nt9.57□□□□□ -0.88
TY1B-GR3Q12316 RRP45YDR280W 918 nt9.56□□□□□ -0.88
TY1B-GR3Q12316 YDR034W-BYDR034W-B 156 nt9.55□□□□□ -0.88
TY1B-GR3Q12316 ASK1YKL052C 879 nt9.55□□□□□ -0.88
TY1B-GR3Q12316 YLR312CYLR312C 1197 nt9.55□□□□□ -0.88
TY1B-GR3Q12316 SNF4YGL115W 969 nt9.54□□□□□ -0.88
TY1B-GR3Q12316 MEH1YKR007W 555 nt9.54□□□□□ -0.88
TY1B-GR3Q12316 tR(ACG)JtR(ACG)J 73 nt9.53□□□□□ -0.88
TY1B-GR3Q12316 VMA16YHR026W 642 nt9.53□□□□□ -0.88
TY1B-GR3Q12316 DCN1YLR128W 810 nt9.53□□□□□ -0.88
TY1B-GR3Q12316 YNR075C-AYNR075C-A 93 nt9.53□□□□□ -0.88
TY1B-GR3Q12316 GNP1YDR508C 1992 nt9.53□□□□□ -0.88
TY1B-GR3Q12316 MTR3YGR158C 753 nt9.52□□□□□ -0.88
TY1B-GR3Q12316 RRS1YOR294W 612 nt9.52□□□□□ -0.88
TY1B-GR3Q12316 YNL120CYNL120C 486 nt9.52□□□□□ -0.89
TY1B-GR3Q12316 VID30YGL227W 2877 nt9.51□□□□□ -0.89
TY1B-GR3Q12316 SYN8YAL014C 768 nt9.51□□□□□ -0.89
TY1B-GR3Q12316 BRL1YHR036W 1416 nt9.51□□□□□ -0.89
TY1B-GR3Q12316 YNL019CYNL019C 855 nt9.5□□□□□ -0.89
TY1B-GR3Q12316 YNL033WYNL033W 855 nt9.5□□□□□ -0.89
TY1B-GR3Q12316 DAP1YPL170W 459 nt9.5□□□□□ -0.89
TY1B-GR3Q12316 ADE13YLR359W 1449 nt9.5□□□□□ -0.89
TY1B-GR3Q12316 SFP1YLR403W 2052 nt9.5□□□□□ -0.89
TY1B-GR3Q12316 GEF1YJR040W 2340 nt9.5□□□□□ -0.89
TY1B-GR3Q12316 DYS1YHR068W 1164 nt9.5□□□□□ -0.89
TY1B-GR3Q12316 ERG3YLR056W 1098 nt9.5□□□□□ -0.89
TY1B-GR3Q12316 YLR112WYLR112W 420 nt9.49□□□□□ -0.89
TY1B-GR3Q12316 IME2YJL106W 1938 nt9.49□□□□□ -0.89
TY1B-GR3Q12316 YFR034W-AYFR034W-A 288 nt9.48□□□□□ -0.89
TY1B-GR3Q12316 YPL264CYPL264C 1062 nt9.48□□□□□ -0.89
TY1B-GR3Q12316 MHP1YJL042W 4197 nt9.48□□□□□ -0.89
TY1B-GR3Q12316 YCR041WYCR041W 333 nt9.47□□□□□ -0.89
TY1B-GR3Q12316 YCR047W-AYCR047W-A 207 nt9.47□□□□□ -0.89
TY1B-GR3Q12316 MRPL13YKR006C 795 nt9.47□□□□□ -0.89
TY1B-GR3Q12316 LOT6YLR011W 576 nt9.47□□□□□ -0.89
TY1B-GR3Q12316 KNH1YDL049C 807 nt9.46□□□□□ -0.9
TY1B-GR3Q12316 RGD2YFL047W 2145 nt9.46□□□□□ -0.9
TY1B-GR3Q12316 EXG1YLR300W 1347 nt9.46□□□□□ -0.9
TY1B-GR3Q12316 GPB2YAL056W 2643 nt9.46□□□□□ -0.9
TY1B-GR3Q12316 HXT9YJL219W 1704 nt9.45□□□□□ -0.9
TY1B-GR3Q12316 ERI1YPL096C-A 207 nt9.45□□□□□ -0.9
TY1B-GR3Q12316 MEX67YPL169C 1800 nt9.44□□□□□ -0.9
TY1B-GR3Q12316 ERS1YCR075C 783 nt9.44□□□□□ -0.9
TY1B-GR3Q12316 ARP2YDL029W 1176 nt9.44□□□□□ -0.9
TY1B-GR3Q12316 MDH3YDL078C 1032 nt9.44□□□□□ -0.9
TY1B-GR3Q12316 YCK1YHR135C 1617 nt9.43□□□□□ -0.9
TY1B-GR3Q12316 HSP26YBR072W 645 nt9.43□□□□□ -0.9
TY1B-GR3Q12316 CCT3YJL014W 1605 nt9.43□□□□□ -0.9
TY1B-GR3Q12316 NUP84YDL116W 2181 nt9.43□□□□□ -0.9
TY1B-GR3Q12316 CBP4YGR174C 513 nt9.42□□□□□ -0.9
TY1B-GR3Q12316 LCB3YJL134W 1230 nt9.42□□□□□ -0.9
TY1B-GR3Q12316 ARR3YPR201W 1215 nt9.42□□□□□ -0.9
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