Protein–RNA interactions for Protein: Q01477

UBP3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBP3Q01477 ACO1YLR304C 2337 nt7.46□□□□□ -1.21
UBP3Q01477 HPT1YDR399W 666 nt7.46□□□□□ -1.22 RIP-Chip
UBP3Q01477 THR1YHR025W 1074 nt7.46□□□□□ -1.22
UBP3Q01477 SML1YML058W 315 nt7.46□□□□□ -1.22
UBP3Q01477 YOL079WYOL079W 399 nt7.46□□□□□ -1.22
UBP3Q01477 GPI18YBR004C 1302 nt7.46□□□□□ -1.22 RIP-Chip
UBP3Q01477 YAL045CYAL045C 309 nt7.45□□□□□ -1.22
UBP3Q01477 PHA2YNL316C 1005 nt7.45□□□□□ -1.22 RIP-Chip
UBP3Q01477 MSO1YNR049C 633 nt7.45□□□□□ -1.22 RIP-Chip
UBP3Q01477 RAI1YGL246C 1164 nt7.44□□□□□ -1.22
UBP3Q01477 RDL1YOR285W 420 nt7.44□□□□□ -1.22
UBP3Q01477 PPS1YBR276C 2424 nt7.44□□□□□ -1.22
UBP3Q01477 ATG7YHR171W 1893 nt7.44□□□□□ -1.22
UBP3Q01477 STD1YOR047C 1335 nt7.44□□□□□ -1.22
UBP3Q01477 AIM3YBR108W 2844 nt7.44□□□□□ -1.22
UBP3Q01477 PTR2YKR093W 1806 nt7.43□□□□□ -1.22
UBP3Q01477 MHP1YJL042W 4197 nt7.43□□□□□ -1.22 RIP-Chip
UBP3Q01477 PTC7YHR076W 1032 nt7.43□□□□□ -1.22
UBP3Q01477 TIF34YMR146C 1044 nt7.43□□□□□ -1.22 RIP-Chip
UBP3Q01477 YNR005CYNR005C 405 nt7.43□□□□□ -1.22
UBP3Q01477 NMD5YJR132W 3147 nt7.43□□□□□ -1.22 RIP-Chip
UBP3Q01477 IRC5YFR038W 2562 nt7.42□□□□□ -1.22
UBP3Q01477 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt7.42□□□□□ -1.22
UBP3Q01477 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt7.42□□□□□ -1.22
UBP3Q01477 ARC19YKL013C 516 nt7.42□□□□□ -1.22
UBP3Q01477 HTZ1YOL012C 405 nt7.42□□□□□ -1.22
UBP3Q01477 YPR127WYPR127W 1038 nt7.42□□□□□ -1.22 RIP-Chip
UBP3Q01477 PRP2YNR011C 2631 nt7.41□□□□□ -1.22
UBP3Q01477 YOR389WYOR389W 1875 nt7.41□□□□□ -1.22
UBP3Q01477 WHI4YDL224C 1950 nt7.41□□□□□ -1.22
UBP3Q01477 YEA6YEL006W 1008 nt7.41□□□□□ -1.22
UBP3Q01477 MED6YHR058C 888 nt7.41□□□□□ -1.22
UBP3Q01477 URA1YKL216W 945 nt7.41□□□□□ -1.22
UBP3Q01477 UBC12YLR306W 567 nt7.41□□□□□ -1.22
UBP3Q01477 MTQ1YNL063W 945 nt7.41□□□□□ -1.22
UBP3Q01477 NTG2YOL043C 1143 nt7.41□□□□□ -1.22
UBP3Q01477 LGE1YPL055C 999 nt7.41□□□□□ -1.22 RIP-Chip
UBP3Q01477 snR34snR34 203 nt7.41□□□□□ -1.22
UBP3Q01477 YLL058WYLL058W 1728 nt7.41□□□□□ -1.22 RIP-Chip
UBP3Q01477 ADK2YER170W 678 nt7.4□□□□□ -1.22
UBP3Q01477 SNF4YGL115W 969 nt7.4□□□□□ -1.22 RIP-Chip
UBP3Q01477 COX3Q0275 810 nt7.4□□□□□ -1.22
UBP3Q01477 YIR043CYIR043C 693 nt7.4□□□□□ -1.22
UBP3Q01477 YJR115WYJR115W 510 nt7.4□□□□□ -1.22
UBP3Q01477 KTR3YBR205W 1215 nt7.4□□□□□ -1.22 RIP-Chip
UBP3Q01477 APE4YHR113W 1473 nt7.4□□□□□ -1.22
UBP3Q01477 NOP7YGR103W 1818 nt7.4□□□□□ -1.23
UBP3Q01477 MSG5YNL053W 1470 nt7.39□□□□□ -1.23
UBP3Q01477 ALG5YPL227C 1005 nt7.39□□□□□ -1.23
UBP3Q01477 KNS1YLL019C 2214 nt7.39□□□□□ -1.23
UBP3Q01477 DLD1YDL174C 1764 nt7.38□□□□□ -1.23 RIP-Chip
UBP3Q01477 TDP1YBR223C 1635 nt7.38□□□□□ -1.23
UBP3Q01477 YEF1YEL041W 1488 nt7.38□□□□□ -1.23
UBP3Q01477 NCS6YGL211W 1080 nt7.38□□□□□ -1.23
UBP3Q01477 GCV3YAL044C 513 nt7.38□□□□□ -1.23
UBP3Q01477 RRT7YLL030C 342 nt7.38□□□□□ -1.23
UBP3Q01477 YOL046CYOL046C 675 nt7.38□□□□□ -1.23
UBP3Q01477 YOL099CYOL099C 492 nt7.38□□□□□ -1.23
UBP3Q01477 AME1YBR211C 975 nt7.38□□□□□ -1.23
UBP3Q01477 SSC1YJR045C 1965 nt7.38□□□□□ -1.23
UBP3Q01477 ADE17YMR120C 1779 nt7.38□□□□□ -1.23 RIP-Chip
UBP3Q01477 BNA5YLR231C 1362 nt7.37□□□□□ -1.23 RIP-Chip
UBP3Q01477 YCR041WYCR041W 333 nt7.37□□□□□ -1.23
UBP3Q01477 YJL144WYJL144W 315 nt7.37□□□□□ -1.23 RIP-Chip
UBP3Q01477 PUS4YNL292W 1212 nt7.37□□□□□ -1.23
UBP3Q01477 HEM15YOR176W 1182 nt7.37□□□□□ -1.23
UBP3Q01477 TIP41YPR040W 1071 nt7.37□□□□□ -1.23 RIP-Chip
UBP3Q01477 SPE3YPR069C 882 nt7.37□□□□□ -1.23
UBP3Q01477 RPO26YPR187W 468 nt7.37□□□□□ -1.23
UBP3Q01477 MPH3YJR160C 1809 nt7.36□□□□□ -1.23
UBP3Q01477 YPL245WYPL245W 1365 nt7.36□□□□□ -1.23
UBP3Q01477 YJL163CYJL163C 1668 nt7.36□□□□□ -1.23 RIP-Chip
UBP3Q01477 YDL157CYDL157C 357 nt7.36□□□□□ -1.23
UBP3Q01477 SRG1SRG1 551 nt7.36□□□□□ -1.23
UBP3Q01477 YOR012WYOR012W 414 nt7.36□□□□□ -1.23
UBP3Q01477 MED4YOR174W 855 nt7.36□□□□□ -1.23
UBP3Q01477 BIO3YNR058W 1443 nt7.35□□□□□ -1.23
UBP3Q01477 CEM1YER061C 1329 nt7.35□□□□□ -1.23 RIP-Chip
UBP3Q01477 YCR006CYCR006C 474 nt7.35□□□□□ -1.23
UBP3Q01477 REC107YJR021C 945 nt7.35□□□□□ -1.23
UBP3Q01477 DIA1YMR316W 1011 nt7.35□□□□□ -1.23 RIP-Chip
UBP3Q01477 ERG10YPL028W 1197 nt7.35□□□□□ -1.23 RIP-Chip
UBP3Q01477 VPS28YPL065W 729 nt7.35□□□□□ -1.23
UBP3Q01477 PEX34YCL056C 435 nt7.35□□□□□ -1.23 RIP-Chip
UBP3Q01477 SGE1YPR198W 1632 nt7.34□□□□□ -1.23
UBP3Q01477 ECM7YLR443W 1347 nt7.34□□□□□ -1.23 RIP-Chip
UBP3Q01477 ERG12YMR208W 1332 nt7.34□□□□□ -1.23
UBP3Q01477 PEX7YDR142C 1128 nt7.34□□□□□ -1.23
UBP3Q01477 YLR112WYLR112W 420 nt7.34□□□□□ -1.23
UBP3Q01477 YBL070CYBL070C 321 nt7.34□□□□□ -1.23
UBP3Q01477 FIT2YOR382W 462 nt7.34□□□□□ -1.23
UBP3Q01477 RFS1YBR052C 633 nt7.34□□□□□ -1.23
UBP3Q01477 YLR283WYLR283W 945 nt7.33□□□□□ -1.24
UBP3Q01477 RUF21RUF21 707 nt7.33□□□□□ -1.24
UBP3Q01477 ISR1YPR106W 1332 nt7.32□□□□□ -1.24
UBP3Q01477 GYP8YFL027C 1494 nt7.32□□□□□ -1.24 RIP-Chip
UBP3Q01477 MAF1YDR005C 1188 nt7.32□□□□□ -1.24
UBP3Q01477 YJR056CYJR056C 711 nt7.32□□□□□ -1.24
UBP3Q01477 SPC24YMR117C 642 nt7.32□□□□□ -1.24
UBP3Q01477 MRPS28YDR337W 861 nt7.31□□□□□ -1.24
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