Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PRCDQ00LT1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PRCDQ00LT1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PRCDQ00LT1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PRCDQ00LT1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PRCDQ00LT1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PRCDQ00LT1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PRCDQ00LT1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PRCDQ00LT1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PRCDQ00LT1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PRCDQ00LT1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PRCDQ00LT1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PRCDQ00LT1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PRCDQ00LT1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PRCDQ00LT1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PRCDQ00LT1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PRCDQ00LT1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PRCDQ00LT1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PRCDQ00LT1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PRCDQ00LT1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PRCDQ00LT1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PRCDQ00LT1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PRCDQ00LT1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PRCDQ00LT1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PRCDQ00LT1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PRCDQ00LT1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PRCDQ00LT1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PRCDQ00LT1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PRCDQ00LT1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PRCDQ00LT1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PRCDQ00LT1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRCDQ00LT1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRCDQ00LT1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PRCDQ00LT1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRCDQ00LT1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRCDQ00LT1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRCDQ00LT1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRCDQ00LT1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRCDQ00LT1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRCDQ00LT1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRCDQ00LT1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRCDQ00LT1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRCDQ00LT1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRCDQ00LT1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRCDQ00LT1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PRCDQ00LT1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRCDQ00LT1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRCDQ00LT1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRCDQ00LT1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRCDQ00LT1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRCDQ00LT1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRCDQ00LT1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PRCDQ00LT1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PRCDQ00LT1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRCDQ00LT1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRCDQ00LT1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRCDQ00LT1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRCDQ00LT1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PRCDQ00LT1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRCDQ00LT1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRCDQ00LT1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRCDQ00LT1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRCDQ00LT1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRCDQ00LT1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PRCDQ00LT1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRCDQ00LT1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRCDQ00LT1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRCDQ00LT1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRCDQ00LT1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRCDQ00LT1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRCDQ00LT1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRCDQ00LT1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRCDQ00LT1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRCDQ00LT1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PRCDQ00LT1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRCDQ00LT1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRCDQ00LT1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRCDQ00LT1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRCDQ00LT1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRCDQ00LT1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRCDQ00LT1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRCDQ00LT1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRCDQ00LT1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRCDQ00LT1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRCDQ00LT1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PRCDQ00LT1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRCDQ00LT1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRCDQ00LT1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRCDQ00LT1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRCDQ00LT1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRCDQ00LT1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PRCDQ00LT1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRCDQ00LT1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRCDQ00LT1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRCDQ00LT1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRCDQ00LT1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRCDQ00LT1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRCDQ00LT1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRCDQ00LT1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRCDQ00LT1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms