Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LOXL3P58215 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LOXL3P58215 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LOXL3P58215 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LOXL3P58215 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LOXL3P58215 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LOXL3P58215 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LOXL3P58215 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LOXL3P58215 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LOXL3P58215 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LOXL3P58215 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LOXL3P58215 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LOXL3P58215 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LOXL3P58215 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LOXL3P58215 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LOXL3P58215 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LOXL3P58215 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LOXL3P58215 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LOXL3P58215 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LOXL3P58215 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LOXL3P58215 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LOXL3P58215 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LOXL3P58215 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LOXL3P58215 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LOXL3P58215 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LOXL3P58215 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LOXL3P58215 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LOXL3P58215 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LOXL3P58215 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LOXL3P58215 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LOXL3P58215 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LOXL3P58215 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LOXL3P58215 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LOXL3P58215 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LOXL3P58215 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LOXL3P58215 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LOXL3P58215 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LOXL3P58215 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LOXL3P58215 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LOXL3P58215 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LOXL3P58215 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LOXL3P58215 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LOXL3P58215 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LOXL3P58215 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LOXL3P58215 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LOXL3P58215 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LOXL3P58215 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LOXL3P58215 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LOXL3P58215 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LOXL3P58215 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LOXL3P58215 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LOXL3P58215 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LOXL3P58215 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LOXL3P58215 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LOXL3P58215 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LOXL3P58215 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LOXL3P58215 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LOXL3P58215 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LOXL3P58215 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LOXL3P58215 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LOXL3P58215 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LOXL3P58215 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LOXL3P58215 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
LOXL3P58215 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LOXL3P58215 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LOXL3P58215 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LOXL3P58215 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LOXL3P58215 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LOXL3P58215 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LOXL3P58215 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LOXL3P58215 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LOXL3P58215 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
LOXL3P58215 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
LOXL3P58215 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LOXL3P58215 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LOXL3P58215 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LOXL3P58215 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
LOXL3P58215 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LOXL3P58215 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LOXL3P58215 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LOXL3P58215 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LOXL3P58215 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LOXL3P58215 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LOXL3P58215 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LOXL3P58215 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LOXL3P58215 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LOXL3P58215 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LOXL3P58215 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LOXL3P58215 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LOXL3P58215 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LOXL3P58215 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LOXL3P58215 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LOXL3P58215 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LOXL3P58215 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LOXL3P58215 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LOXL3P58215 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LOXL3P58215 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LOXL3P58215 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LOXL3P58215 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LOXL3P58215 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms