Protein–RNA interactions for Protein: P55884

EIF3B, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3BP55884 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EIF3BP55884 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EIF3BP55884 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25■■□□□ 1.59
EIF3BP55884 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25■■□□□ 1.59
EIF3BP55884 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
EIF3BP55884 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
EIF3BP55884 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EIF3BP55884 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EIF3BP55884 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EIF3BP55884 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EIF3BP55884 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EIF3BP55884 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EIF3BP55884 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EIF3BP55884 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EIF3BP55884 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EIF3BP55884 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EIF3BP55884 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF3BP55884 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF3BP55884 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF3BP55884 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF3BP55884 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF3BP55884 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF3BP55884 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF3BP55884 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF3BP55884 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EIF3BP55884 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EIF3BP55884 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EIF3BP55884 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EIF3BP55884 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EIF3BP55884 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EIF3BP55884 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EIF3BP55884 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EIF3BP55884 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EIF3BP55884 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EIF3BP55884 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
EIF3BP55884 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
EIF3BP55884 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
EIF3BP55884 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
EIF3BP55884 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EIF3BP55884 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EIF3BP55884 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EIF3BP55884 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EIF3BP55884 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EIF3BP55884 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EIF3BP55884 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EIF3BP55884 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EIF3BP55884 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EIF3BP55884 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EIF3BP55884 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
EIF3BP55884 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
EIF3BP55884 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
EIF3BP55884 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EIF3BP55884 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EIF3BP55884 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EIF3BP55884 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EIF3BP55884 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EIF3BP55884 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EIF3BP55884 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EIF3BP55884 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
EIF3BP55884 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
EIF3BP55884 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
EIF3BP55884 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
EIF3BP55884 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
EIF3BP55884 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
EIF3BP55884 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
EIF3BP55884 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
EIF3BP55884 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
EIF3BP55884 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EIF3BP55884 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EIF3BP55884 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
EIF3BP55884 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EIF3BP55884 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EIF3BP55884 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EIF3BP55884 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EIF3BP55884 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EIF3BP55884 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
EIF3BP55884 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EIF3BP55884 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EIF3BP55884 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EIF3BP55884 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EIF3BP55884 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EIF3BP55884 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EIF3BP55884 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EIF3BP55884 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EIF3BP55884 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EIF3BP55884 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EIF3BP55884 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EIF3BP55884 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EIF3BP55884 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EIF3BP55884 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EIF3BP55884 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EIF3BP55884 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EIF3BP55884 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EIF3BP55884 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EIF3BP55884 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EIF3BP55884 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EIF3BP55884 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
EIF3BP55884 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF3BP55884 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF3BP55884 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms