Protein–RNA interactions for Protein: P55290

CDH13, Cadherin-13, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH13P55290 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDH13P55290 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDH13P55290 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDH13P55290 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDH13P55290 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDH13P55290 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDH13P55290 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDH13P55290 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDH13P55290 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDH13P55290 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDH13P55290 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CDH13P55290 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDH13P55290 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDH13P55290 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDH13P55290 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDH13P55290 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDH13P55290 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDH13P55290 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDH13P55290 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDH13P55290 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CDH13P55290 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CDH13P55290 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDH13P55290 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CDH13P55290 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDH13P55290 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDH13P55290 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDH13P55290 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CDH13P55290 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CDH13P55290 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDH13P55290 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDH13P55290 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDH13P55290 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDH13P55290 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDH13P55290 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDH13P55290 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDH13P55290 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDH13P55290 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDH13P55290 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDH13P55290 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDH13P55290 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDH13P55290 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDH13P55290 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDH13P55290 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDH13P55290 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDH13P55290 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
CDH13P55290 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDH13P55290 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDH13P55290 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDH13P55290 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDH13P55290 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDH13P55290 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDH13P55290 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDH13P55290 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH13P55290 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH13P55290 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH13P55290 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH13P55290 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH13P55290 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH13P55290 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH13P55290 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH13P55290 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH13P55290 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH13P55290 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH13P55290 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH13P55290 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH13P55290 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH13P55290 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH13P55290 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH13P55290 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH13P55290 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH13P55290 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH13P55290 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH13P55290 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH13P55290 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH13P55290 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH13P55290 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH13P55290 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH13P55290 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH13P55290 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH13P55290 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH13P55290 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH13P55290 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH13P55290 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH13P55290 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH13P55290 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH13P55290 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDH13P55290 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDH13P55290 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDH13P55290 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH13P55290 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH13P55290 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH13P55290 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH13P55290 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH13P55290 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH13P55290 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH13P55290 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH13P55290 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH13P55290 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH13P55290 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH13P55290 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms