Protein–RNA interactions for Protein: P55289

CDH12, Cadherin-12, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH12P55289 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH12P55289 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH12P55289 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH12P55289 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDH12P55289 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH12P55289 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH12P55289 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH12P55289 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH12P55289 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH12P55289 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH12P55289 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH12P55289 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH12P55289 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH12P55289 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH12P55289 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH12P55289 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH12P55289 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH12P55289 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH12P55289 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH12P55289 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH12P55289 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH12P55289 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH12P55289 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH12P55289 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH12P55289 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH12P55289 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH12P55289 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH12P55289 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH12P55289 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH12P55289 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH12P55289 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH12P55289 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH12P55289 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH12P55289 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH12P55289 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH12P55289 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH12P55289 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH12P55289 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH12P55289 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH12P55289 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CDH12P55289 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH12P55289 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH12P55289 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH12P55289 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH12P55289 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH12P55289 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH12P55289 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH12P55289 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH12P55289 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH12P55289 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH12P55289 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH12P55289 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH12P55289 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH12P55289 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH12P55289 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH12P55289 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH12P55289 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH12P55289 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH12P55289 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH12P55289 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH12P55289 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH12P55289 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH12P55289 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH12P55289 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH12P55289 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH12P55289 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH12P55289 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH12P55289 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH12P55289 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH12P55289 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH12P55289 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH12P55289 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH12P55289 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH12P55289 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH12P55289 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH12P55289 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH12P55289 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDH12P55289 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH12P55289 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH12P55289 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH12P55289 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH12P55289 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH12P55289 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH12P55289 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH12P55289 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH12P55289 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH12P55289 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH12P55289 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH12P55289 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH12P55289 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH12P55289 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH12P55289 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH12P55289 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH12P55289 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH12P55289 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH12P55289 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH12P55289 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH12P55289 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH12P55289 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH12P55289 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms