Protein–RNA interactions for Protein: P53999

SUB1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUB1P53999 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.763e-10■■■■■ 48.8
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SUB1P53999 TXNL4A-202ENST00000355491 803 ntTSL 1 (best)14.46□□□□□ -0.093e-10■■■■■ 48.8
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SUB1P53999 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.143e-10■■■■■ 48.8
SUB1P53999 TXNL4A-206ENST00000586612 448 ntTSL 313.47□□□□□ -0.253e-10■■■■■ 48.8
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SUB1P53999 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.472e-15■■■■■ 48.8
SUB1P53999 OCIAD1-205ENST00000444354 1756 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.992e-15■■■■■ 48.8
SUB1P53999 OCIAD1-203ENST00000396448 1306 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.992e-15■■■■■ 48.8
SUB1P53999 OCIAD1-226ENST00000513391 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.052e-15■■■■■ 48.8
SUB1P53999 OCIAD1-201ENST00000264312 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.062e-15■■■■■ 48.8
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SUB1P53999 PSMA2-204ENST00000445517 683 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.424e-8■■■■■ 48.8
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SUB1P53999 RPS27A-203ENST00000404735 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.242e-17■■■■■ 48.8
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SUB1P53999 MSN-201ENST00000360270 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.297e-9■■■■■ 48.7
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SUB1P53999 CSE1L-201ENST00000262982 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.941e-8■■■■■ 48.5
SUB1P53999 CSE1L-202ENST00000396192 3459 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -11e-8■■■■■ 48.5
SUB1P53999 CSE1L-203ENST00000469700 1401 ntTSL 1 (best)3.87□□□□□ -1.791e-8■■■■■ 48.5
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SUB1P53999 SEC23B-203ENST00000377465 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.062e-6■■■■■ 48.4
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SUB1P53999 MCCC2-201ENST00000340941 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.894e-10■■■■■ 48.4
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SUB1P53999 CFL1-207ENST00000527752 766 ntTSL 58.51□□□□□ -1.058e-13■■■■■ 47.6
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SUB1P53999 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.157e-7■■■■■ 47.6
SUB1P53999 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.417e-7■■■■■ 47.6
SUB1P53999 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.437e-7■■■■■ 47.6
SUB1P53999 TOM1-216ENST00000492723 2568 ntTSL 213.45□□□□□ -0.264e-10■■■■■ 47.4
SUB1P53999 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.264e-10■■■■■ 47.4
SUB1P53999 DCTN1-225ENST00000497666 479 ntTSL 312.28□□□□□ -0.444e-10■■■■■ 47.4
SUB1P53999 DCTN1-221ENST00000491465 2444 ntTSL 1 (best)12.03□□□□□ -0.484e-10■■■■■ 47.4
SUB1P53999 DCTN1-218ENST00000466110 5414 ntTSL 211.93□□□□□ -0.54e-10■■■■■ 47.4
SUB1P53999 DCTN1-210ENST00000434055 4229 ntTSL 210.56□□□□□ -0.724e-10■■■■■ 47.4
SUB1P53999 PHF5A-203ENST00000491254 292 ntTSL 310.5□□□□□ -0.734e-10■■■■■ 47.4
SUB1P53999 DCTN1-206ENST00000409868 4202 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.784e-10■■■■■ 47.4
SUB1P53999 AC006030.1-201ENST00000451608 5059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.84e-10■■■■■ 47.4
SUB1P53999 DCTN1-201ENST00000361874 4500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.84e-10■■■■■ 47.4
SUB1P53999 DCTN1-227ENST00000633691 4160 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.864e-10■■■■■ 47.4
SUB1P53999 DCTN1-202ENST00000394003 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.914e-10■■■■■ 47.4
SUB1P53999 DCTN1-204ENST00000409438 4145 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.934e-10■■■■■ 47.4
SUB1P53999 DCTN1-226ENST00000628224 4485 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.044e-10■■■■■ 47.4
SUB1P53999 PHF5A-201ENST00000216252 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.54e-10■■■■■ 47.4
SUB1P53999 PHF5A-202ENST00000459687 504 ntTSL 34.61□□□□□ -1.674e-10■■■■■ 47.4
SUB1P53999 SF3B3-205ENST00000564899 551 ntTSL 48.73□□□□□ -1.012e-9■■■■■ 47.3
SUB1P53999 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.247e-7■■■■■ 47.3
SUB1P53999 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.37e-7■■■■■ 47.3
SUB1P53999 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.337e-7■■■■■ 47.3
SUB1P53999 SUCLA2-206ENST00000481279 466 ntTSL 33.7□□□□□ -1.827e-7■■■■■ 47.3
SUB1P53999 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.877e-7■■■■■ 47.3
SUB1P53999 ORMDL1-207ENST00000496543 723 ntTSL 33.17□□□□□ -1.97e-7■■■■■ 47.3
SUB1P53999 SUCLA2-208ENST00000493152 552 ntTSL 31.08□□□□□ -2.247e-7■■■■■ 47.3
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