Protein–RNA interactions for Protein: P51788

CLCN2, Chloride channel protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN2P51788 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLCN2P51788 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLCN2P51788 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLCN2P51788 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLCN2P51788 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLCN2P51788 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLCN2P51788 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLCN2P51788 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLCN2P51788 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLCN2P51788 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCN2P51788 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCN2P51788 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCN2P51788 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCN2P51788 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCN2P51788 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCN2P51788 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCN2P51788 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCN2P51788 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCN2P51788 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCN2P51788 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCN2P51788 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCN2P51788 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCN2P51788 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCN2P51788 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCN2P51788 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCN2P51788 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCN2P51788 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCN2P51788 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCN2P51788 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCN2P51788 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCN2P51788 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCN2P51788 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCN2P51788 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCN2P51788 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCN2P51788 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCN2P51788 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCN2P51788 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCN2P51788 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCN2P51788 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCN2P51788 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCN2P51788 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCN2P51788 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CLCN2P51788 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLCN2P51788 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLCN2P51788 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLCN2P51788 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLCN2P51788 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLCN2P51788 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLCN2P51788 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLCN2P51788 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CLCN2P51788 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLCN2P51788 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLCN2P51788 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLCN2P51788 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLCN2P51788 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLCN2P51788 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLCN2P51788 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLCN2P51788 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLCN2P51788 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CLCN2P51788 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLCN2P51788 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLCN2P51788 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLCN2P51788 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLCN2P51788 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLCN2P51788 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLCN2P51788 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLCN2P51788 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLCN2P51788 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLCN2P51788 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLCN2P51788 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLCN2P51788 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLCN2P51788 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLCN2P51788 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLCN2P51788 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLCN2P51788 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLCN2P51788 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLCN2P51788 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLCN2P51788 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLCN2P51788 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLCN2P51788 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLCN2P51788 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLCN2P51788 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLCN2P51788 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLCN2P51788 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLCN2P51788 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLCN2P51788 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLCN2P51788 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLCN2P51788 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLCN2P51788 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLCN2P51788 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLCN2P51788 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLCN2P51788 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLCN2P51788 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLCN2P51788 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLCN2P51788 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLCN2P51788 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLCN2P51788 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLCN2P51788 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLCN2P51788 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CLCN2P51788 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms