Protein–RNA interactions for Protein: P41743

PRKCI, Protein kinase C iota type, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCIP41743 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRKCIP41743 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PRKCIP41743 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRKCIP41743 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRKCIP41743 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRKCIP41743 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PRKCIP41743 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRKCIP41743 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRKCIP41743 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRKCIP41743 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRKCIP41743 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRKCIP41743 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRKCIP41743 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRKCIP41743 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRKCIP41743 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRKCIP41743 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRKCIP41743 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRKCIP41743 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRKCIP41743 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRKCIP41743 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKCIP41743 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKCIP41743 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKCIP41743 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKCIP41743 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKCIP41743 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKCIP41743 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKCIP41743 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKCIP41743 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKCIP41743 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKCIP41743 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKCIP41743 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKCIP41743 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKCIP41743 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKCIP41743 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKCIP41743 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKCIP41743 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKCIP41743 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKCIP41743 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKCIP41743 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKCIP41743 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRKCIP41743 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRKCIP41743 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRKCIP41743 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PRKCIP41743 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRKCIP41743 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRKCIP41743 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKCIP41743 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKCIP41743 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKCIP41743 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKCIP41743 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKCIP41743 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKCIP41743 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKCIP41743 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKCIP41743 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRKCIP41743 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRKCIP41743 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRKCIP41743 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRKCIP41743 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRKCIP41743 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRKCIP41743 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRKCIP41743 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRKCIP41743 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRKCIP41743 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRKCIP41743 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PRKCIP41743 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PRKCIP41743 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PRKCIP41743 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRKCIP41743 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRKCIP41743 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRKCIP41743 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRKCIP41743 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PRKCIP41743 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRKCIP41743 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PRKCIP41743 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKCIP41743 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKCIP41743 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKCIP41743 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKCIP41743 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKCIP41743 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKCIP41743 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRKCIP41743 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRKCIP41743 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRKCIP41743 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PRKCIP41743 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRKCIP41743 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRKCIP41743 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRKCIP41743 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRKCIP41743 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRKCIP41743 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRKCIP41743 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKCIP41743 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKCIP41743 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKCIP41743 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKCIP41743 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRKCIP41743 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRKCIP41743 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRKCIP41743 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRKCIP41743 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PRKCIP41743 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PRKCIP41743 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms