Protein–RNA interactions for Protein: P40429

RPL13A, 60S ribosomal protein L13a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL13AP40429 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL13AP40429 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL13AP40429 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL13AP40429 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL13AP40429 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL13AP40429 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL13AP40429 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL13AP40429 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL13AP40429 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL13AP40429 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL13AP40429 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL13AP40429 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL13AP40429 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL13AP40429 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL13AP40429 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL13AP40429 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL13AP40429 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL13AP40429 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL13AP40429 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL13AP40429 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL13AP40429 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL13AP40429 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL13AP40429 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL13AP40429 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL13AP40429 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL13AP40429 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL13AP40429 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL13AP40429 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL13AP40429 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL13AP40429 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL13AP40429 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL13AP40429 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL13AP40429 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL13AP40429 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL13AP40429 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL13AP40429 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL13AP40429 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL13AP40429 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL13AP40429 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL13AP40429 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL13AP40429 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL13AP40429 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL13AP40429 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL13AP40429 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL13AP40429 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL13AP40429 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL13AP40429 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL13AP40429 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL13AP40429 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL13AP40429 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL13AP40429 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL13AP40429 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL13AP40429 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL13AP40429 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL13AP40429 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL13AP40429 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL13AP40429 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL13AP40429 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL13AP40429 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL13AP40429 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL13AP40429 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL13AP40429 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL13AP40429 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL13AP40429 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL13AP40429 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL13AP40429 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL13AP40429 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL13AP40429 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL13AP40429 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL13AP40429 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL13AP40429 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL13AP40429 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL13AP40429 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL13AP40429 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL13AP40429 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL13AP40429 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL13AP40429 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL13AP40429 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL13AP40429 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL13AP40429 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL13AP40429 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPL13AP40429 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPL13AP40429 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPL13AP40429 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPL13AP40429 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPL13AP40429 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPL13AP40429 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPL13AP40429 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPL13AP40429 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPL13AP40429 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPL13AP40429 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPL13AP40429 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPL13AP40429 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPL13AP40429 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPL13AP40429 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPL13AP40429 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPL13AP40429 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPL13AP40429 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPL13AP40429 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
RPL13AP40429 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms