Protein–RNA interactions for Protein: P35900

KRT20, Keratin, type I cytoskeletal 20, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT20P35900 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT20P35900 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT20P35900 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT20P35900 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT20P35900 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT20P35900 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT20P35900 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT20P35900 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT20P35900 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT20P35900 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT20P35900 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT20P35900 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT20P35900 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT20P35900 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT20P35900 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT20P35900 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT20P35900 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT20P35900 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT20P35900 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT20P35900 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT20P35900 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT20P35900 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT20P35900 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT20P35900 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT20P35900 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT20P35900 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT20P35900 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT20P35900 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT20P35900 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT20P35900 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT20P35900 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT20P35900 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT20P35900 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT20P35900 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT20P35900 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT20P35900 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT20P35900 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT20P35900 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT20P35900 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT20P35900 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT20P35900 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT20P35900 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT20P35900 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT20P35900 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT20P35900 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT20P35900 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT20P35900 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT20P35900 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT20P35900 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT20P35900 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT20P35900 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT20P35900 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT20P35900 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT20P35900 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT20P35900 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT20P35900 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT20P35900 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT20P35900 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT20P35900 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT20P35900 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT20P35900 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT20P35900 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT20P35900 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT20P35900 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT20P35900 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT20P35900 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT20P35900 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT20P35900 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT20P35900 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT20P35900 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT20P35900 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT20P35900 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT20P35900 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT20P35900 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT20P35900 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT20P35900 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT20P35900 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT20P35900 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT20P35900 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT20P35900 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT20P35900 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT20P35900 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KRT20P35900 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KRT20P35900 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT20P35900 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT20P35900 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT20P35900 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT20P35900 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT20P35900 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT20P35900 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT20P35900 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT20P35900 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT20P35900 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT20P35900 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT20P35900 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT20P35900 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT20P35900 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT20P35900 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT20P35900 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT20P35900 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms