Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP5DP30049 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP5DP30049 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP5DP30049 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP5DP30049 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP5DP30049 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP5DP30049 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP5DP30049 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP5DP30049 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP5DP30049 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP5DP30049 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP5DP30049 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP5DP30049 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP5DP30049 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP5DP30049 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP5DP30049 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP5DP30049 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP5DP30049 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP5DP30049 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ATP5DP30049 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP5DP30049 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP5DP30049 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP5DP30049 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP5DP30049 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP5DP30049 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP5DP30049 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP5DP30049 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP5DP30049 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP5DP30049 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP5DP30049 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP5DP30049 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP5DP30049 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP5DP30049 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP5DP30049 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP5DP30049 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP5DP30049 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP5DP30049 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP5DP30049 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP5DP30049 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP5DP30049 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP5DP30049 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP5DP30049 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP5DP30049 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP5DP30049 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP5DP30049 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP5DP30049 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP5DP30049 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP5DP30049 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP5DP30049 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP5DP30049 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP5DP30049 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP5DP30049 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP5DP30049 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP5DP30049 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP5DP30049 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP5DP30049 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP5DP30049 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP5DP30049 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP5DP30049 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP5DP30049 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP5DP30049 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP5DP30049 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP5DP30049 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP5DP30049 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP5DP30049 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP5DP30049 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP5DP30049 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP5DP30049 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP5DP30049 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP5DP30049 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP5DP30049 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP5DP30049 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP5DP30049 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP5DP30049 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP5DP30049 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP5DP30049 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP5DP30049 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP5DP30049 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP5DP30049 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP5DP30049 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP5DP30049 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP5DP30049 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP5DP30049 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP5DP30049 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP5DP30049 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP5DP30049 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP5DP30049 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP5DP30049 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP5DP30049 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP5DP30049 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP5DP30049 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP5DP30049 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP5DP30049 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP5DP30049 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP5DP30049 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP5DP30049 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP5DP30049 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP5DP30049 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP5DP30049 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP5DP30049 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms