Protein–RNA interactions for Protein: P28817

EHD3, 3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
EHD3P28817 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt5.86□□□□□ -1.47
EHD3P28817 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt5.86□□□□□ -1.47
EHD3P28817 COX16YJL003W 357 nt5.86□□□□□ -1.47
EHD3P28817 KSH1YNL024C-A 219 nt5.86□□□□□ -1.47
EHD3P28817 MET8YBR213W 825 nt5.86□□□□□ -1.47
EHD3P28817 PRY3YJL078C 2646 nt5.86□□□□□ -1.47
EHD3P28817 YBR284WYBR284W 2394 nt5.86□□□□□ -1.47
EHD3P28817 MPA43YNL249C 1629 nt5.85□□□□□ -1.47
EHD3P28817 OPI8YKR035C 642 nt5.85□□□□□ -1.47
EHD3P28817 STT3YGL022W 2157 nt5.84□□□□□ -1.47
EHD3P28817 YIL055CYIL055C 1884 nt5.84□□□□□ -1.47
EHD3P28817 PPH22YDL188C 1134 nt5.84□□□□□ -1.47
EHD3P28817 HIS1YER055C 894 nt5.84□□□□□ -1.47
EHD3P28817 YUR1YJL139C 1287 nt5.84□□□□□ -1.47
EHD3P28817 YJR146WYJR146W 354 nt5.84□□□□□ -1.47
EHD3P28817 MHT1YLL062C 975 nt5.84□□□□□ -1.47
EHD3P28817 RUF23RUF23 254 nt5.84□□□□□ -1.47
EHD3P28817 YNR014WYNR014W 639 nt5.84□□□□□ -1.47
EHD3P28817 EDE1YBL047C 4146 nt5.84□□□□□ -1.48
EHD3P28817 ISC1YER019W 1434 nt5.83□□□□□ -1.48
EHD3P28817 VMA3YEL027W 483 nt5.83□□□□□ -1.48
EHD3P28817 ERP2YAL007C 648 nt5.83□□□□□ -1.48
EHD3P28817 MIA40YKL195W 1212 nt5.83□□□□□ -1.48
EHD3P28817 YBL070CYBL070C 321 nt5.83□□□□□ -1.48
EHD3P28817 NMT1YLR195C 1368 nt5.82□□□□□ -1.48
EHD3P28817 FAL1YDR021W 1200 nt5.82□□□□□ -1.48
EHD3P28817 YDR415CYDR415C 1125 nt5.82□□□□□ -1.48
EHD3P28817 LYS1YIR034C 1122 nt5.82□□□□□ -1.48
EHD3P28817 MDH1YKL085W 1005 nt5.82□□□□□ -1.48
EHD3P28817 OGG1YML060W 1131 nt5.82□□□□□ -1.48
EHD3P28817 ATP4YPL078C 735 nt5.82□□□□□ -1.48
EHD3P28817 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt5.82□□□□□ -1.48
EHD3P28817 MKK1YOR231W 1527 nt5.82□□□□□ -1.48
EHD3P28817 RIO1YOR119C 1455 nt5.82□□□□□ -1.48
EHD3P28817 CCT8YJL008C 1707 nt5.82□□□□□ -1.48
EHD3P28817 YHR218W-AYHR218W-A 318 nt5.81□□□□□ -1.48
EHD3P28817 POR2YIL114C 846 nt5.81□□□□□ -1.48
EHD3P28817 TSR2YLR435W 618 nt5.81□□□□□ -1.48
EHD3P28817 YBL112CYBL112C 318 nt5.81□□□□□ -1.48
EHD3P28817 YBR027CYBR027C 333 nt5.81□□□□□ -1.48
EHD3P28817 CTF19YPL018W 1110 nt5.81□□□□□ -1.48
EHD3P28817 YPL257WYPL257W 582 nt5.81□□□□□ -1.48
EHD3P28817 SLA2YNL243W 2907 nt5.81□□□□□ -1.48
EHD3P28817 PEX31YGR004W 1389 nt5.8□□□□□ -1.48
EHD3P28817 UIP5YKR044W 1332 nt5.8□□□□□ -1.48
EHD3P28817 NSE5YML023C 1671 nt5.8□□□□□ -1.48
EHD3P28817 YPT1YFL038C 621 nt5.8□□□□□ -1.48
EHD3P28817 FZF1YGL254W 900 nt5.8□□□□□ -1.48
EHD3P28817 TFG2YGR005C 1203 nt5.8□□□□□ -1.48
EHD3P28817 YKR045CYKR045C 552 nt5.8□□□□□ -1.48
EHD3P28817 YLR361C-AYLR361C-A 297 nt5.8□□□□□ -1.48
EHD3P28817 DFR1YOR236W 636 nt5.8□□□□□ -1.48
EHD3P28817 NME1NME1 340 nt5.8□□□□□ -1.48
EHD3P28817 JIP4YDR475C 2631 nt5.8□□□□□ -1.48
EHD3P28817 CYC8YBR112C 2901 nt5.8□□□□□ -1.48
EHD3P28817 ATF1YOR377W 1578 nt5.8□□□□□ -1.48
EHD3P28817 RAP1YNL216W 2484 nt5.8□□□□□ -1.48
EHD3P28817 GPD2YOL059W 1323 nt5.79□□□□□ -1.48
EHD3P28817 SHO1YER118C 1104 nt5.79□□□□□ -1.48
EHD3P28817 YMR252CYMR252C 405 nt5.79□□□□□ -1.48
EHD3P28817 TOS6YNL300W 309 nt5.79□□□□□ -1.48
EHD3P28817 RPL5YPL131W 894 nt5.79□□□□□ -1.48
EHD3P28817 ADH5YBR145W 1056 nt5.79□□□□□ -1.48
EHD3P28817 SLX5YDL013W 1860 nt5.79□□□□□ -1.48
EHD3P28817 ZWF1YNL241C 1518 nt5.79□□□□□ -1.48
EHD3P28817 POP1YNL221C 2628 nt5.78□□□□□ -1.48
EHD3P28817 YFR006WYFR006W 1608 nt5.78□□□□□ -1.48
EHD3P28817 HXT15YDL245C 1704 nt5.78□□□□□ -1.48
EHD3P28817 GAL83YER027C 1254 nt5.78□□□□□ -1.48
EHD3P28817 YJR107WYJR107W 987 nt5.78□□□□□ -1.48
EHD3P28817 HXT16YJR158W 1704 nt5.78□□□□□ -1.48
EHD3P28817 YKR032WYKR032W 315 nt5.78□□□□□ -1.48
EHD3P28817 OSW2YLR054C 2175 nt5.78□□□□□ -1.48
EHD3P28817 YLR184WYLR184W 348 nt5.78□□□□□ -1.48
EHD3P28817 CIT3YPR001W 1461 nt5.77□□□□□ -1.49
EHD3P28817 YGR127WYGR127W 939 nt5.77□□□□□ -1.49
EHD3P28817 SCS7YMR272C 1155 nt5.77□□□□□ -1.49
EHD3P28817 YBR226CYBR226C 411 nt5.77□□□□□ -1.49
EHD3P28817 HEM1YDR232W 1647 nt5.77□□□□□ -1.49
EHD3P28817 EFT2YDR385W 2529 nt5.77□□□□□ -1.49
EHD3P28817 EFT1YOR133W 2529 nt5.77□□□□□ -1.49
EHD3P28817 ACS1YAL054C 2142 nt5.77□□□□□ -1.49
EHD3P28817 snR82snR82 268 nt5.76□□□□□ -1.49
EHD3P28817 CUP2YGL166W 678 nt5.76□□□□□ -1.49
EHD3P28817 DYS1YHR068W 1164 nt5.76□□□□□ -1.49
EHD3P28817 DRE2YKR071C 1047 nt5.76□□□□□ -1.49
EHD3P28817 YMR122CYMR122C 375 nt5.76□□□□□ -1.49
EHD3P28817 YNL120CYNL120C 486 nt5.76□□□□□ -1.49
EHD3P28817 LAG2YOL025W 1983 nt5.76□□□□□ -1.49
EHD3P28817 YDR187CYDR187C 519 nt5.75□□□□□ -1.49
EHD3P28817 DID2YKR035W-A 615 nt5.75□□□□□ -1.49
EHD3P28817 TAE1YBR261C 699 nt5.75□□□□□ -1.49
EHD3P28817 ARE2YNR019W 1929 nt5.74□□□□□ -1.49
EHD3P28817 TDH2YJR009C 999 nt5.74□□□□□ -1.49
EHD3P28817 MDE1YJR024C 735 nt5.74□□□□□ -1.49
EHD3P28817 MSO1YNR049C 633 nt5.74□□□□□ -1.49
EHD3P28817 LDB16YCL005W 771 nt5.74□□□□□ -1.49
EHD3P28817 YMR279CYMR279C 1623 nt5.74□□□□□ -1.49
EHD3P28817 PEX3YDR329C 1326 nt5.74□□□□□ -1.49
EHD3P28817 MIP1YOR330C 3765 nt5.73□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 328.5 ms