Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCNE1P24864 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCNE1P24864 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCNE1P24864 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCNE1P24864 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCNE1P24864 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCNE1P24864 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCNE1P24864 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCNE1P24864 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCNE1P24864 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCNE1P24864 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCNE1P24864 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCNE1P24864 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCNE1P24864 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCNE1P24864 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCNE1P24864 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCNE1P24864 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCNE1P24864 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCNE1P24864 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCNE1P24864 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCNE1P24864 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCNE1P24864 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCNE1P24864 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCNE1P24864 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCNE1P24864 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCNE1P24864 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCNE1P24864 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCNE1P24864 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCNE1P24864 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CCNE1P24864 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CCNE1P24864 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCNE1P24864 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CCNE1P24864 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCNE1P24864 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCNE1P24864 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCNE1P24864 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCNE1P24864 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCNE1P24864 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCNE1P24864 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCNE1P24864 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCNE1P24864 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCNE1P24864 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCNE1P24864 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCNE1P24864 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCNE1P24864 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCNE1P24864 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCNE1P24864 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
CCNE1P24864 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCNE1P24864 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCNE1P24864 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCNE1P24864 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCNE1P24864 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCNE1P24864 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCNE1P24864 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCNE1P24864 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCNE1P24864 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCNE1P24864 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCNE1P24864 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCNE1P24864 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCNE1P24864 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCNE1P24864 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCNE1P24864 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCNE1P24864 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCNE1P24864 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCNE1P24864 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCNE1P24864 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCNE1P24864 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCNE1P24864 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCNE1P24864 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCNE1P24864 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCNE1P24864 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCNE1P24864 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCNE1P24864 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCNE1P24864 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCNE1P24864 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCNE1P24864 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCNE1P24864 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCNE1P24864 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCNE1P24864 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCNE1P24864 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCNE1P24864 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CCNE1P24864 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CCNE1P24864 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CCNE1P24864 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCNE1P24864 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCNE1P24864 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCNE1P24864 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCNE1P24864 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCNE1P24864 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CCNE1P24864 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCNE1P24864 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCNE1P24864 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCNE1P24864 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCNE1P24864 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCNE1P24864 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCNE1P24864 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCNE1P24864 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCNE1P24864 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCNE1P24864 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCNE1P24864 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.2 ms