Protein–RNA interactions for Protein: P14136

GFAP, Glial fibrillary acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFAPP14136 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GFAPP14136 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GFAPP14136 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GFAPP14136 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GFAPP14136 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GFAPP14136 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GFAPP14136 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GFAPP14136 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GFAPP14136 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GFAPP14136 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GFAPP14136 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GFAPP14136 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GFAPP14136 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GFAPP14136 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GFAPP14136 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GFAPP14136 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GFAPP14136 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GFAPP14136 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GFAPP14136 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GFAPP14136 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GFAPP14136 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GFAPP14136 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GFAPP14136 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GFAPP14136 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GFAPP14136 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GFAPP14136 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GFAPP14136 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GFAPP14136 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GFAPP14136 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GFAPP14136 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GFAPP14136 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GFAPP14136 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GFAPP14136 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GFAPP14136 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GFAPP14136 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GFAPP14136 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GFAPP14136 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GFAPP14136 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GFAPP14136 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GFAPP14136 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GFAPP14136 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GFAPP14136 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GFAPP14136 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GFAPP14136 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GFAPP14136 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GFAPP14136 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GFAPP14136 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GFAPP14136 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GFAPP14136 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GFAPP14136 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GFAPP14136 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GFAPP14136 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GFAPP14136 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GFAPP14136 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GFAPP14136 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GFAPP14136 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GFAPP14136 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GFAPP14136 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GFAPP14136 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GFAPP14136 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GFAPP14136 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GFAPP14136 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GFAPP14136 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GFAPP14136 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GFAPP14136 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GFAPP14136 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GFAPP14136 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GFAPP14136 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GFAPP14136 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GFAPP14136 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GFAPP14136 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GFAPP14136 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GFAPP14136 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GFAPP14136 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GFAPP14136 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GFAPP14136 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GFAPP14136 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GFAPP14136 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GFAPP14136 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GFAPP14136 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GFAPP14136 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GFAPP14136 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GFAPP14136 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GFAPP14136 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GFAPP14136 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GFAPP14136 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GFAPP14136 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GFAPP14136 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GFAPP14136 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GFAPP14136 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GFAPP14136 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GFAPP14136 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GFAPP14136 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GFAPP14136 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GFAPP14136 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GFAPP14136 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GFAPP14136 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GFAPP14136 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GFAPP14136 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GFAPP14136 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms