Protein–RNA interactions for Protein: P13804

ETFA, Electron transfer flavoprotein subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFAP13804 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ETFAP13804 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ETFAP13804 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ETFAP13804 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ETFAP13804 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ETFAP13804 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ETFAP13804 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ETFAP13804 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ETFAP13804 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ETFAP13804 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ETFAP13804 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ETFAP13804 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ETFAP13804 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ETFAP13804 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ETFAP13804 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ETFAP13804 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ETFAP13804 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ETFAP13804 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ETFAP13804 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ETFAP13804 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ETFAP13804 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ETFAP13804 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ETFAP13804 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ETFAP13804 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ETFAP13804 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ETFAP13804 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ETFAP13804 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ETFAP13804 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ETFAP13804 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ETFAP13804 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ETFAP13804 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ETFAP13804 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ETFAP13804 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ETFAP13804 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ETFAP13804 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ETFAP13804 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ETFAP13804 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ETFAP13804 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ETFAP13804 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ETFAP13804 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ETFAP13804 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ETFAP13804 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ETFAP13804 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ETFAP13804 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ETFAP13804 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ETFAP13804 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ETFAP13804 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ETFAP13804 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ETFAP13804 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ETFAP13804 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ETFAP13804 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ETFAP13804 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ETFAP13804 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ETFAP13804 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ETFAP13804 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ETFAP13804 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ETFAP13804 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ETFAP13804 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ETFAP13804 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ETFAP13804 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ETFAP13804 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ETFAP13804 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ETFAP13804 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ETFAP13804 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ETFAP13804 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ETFAP13804 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ETFAP13804 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ETFAP13804 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ETFAP13804 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ETFAP13804 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ETFAP13804 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ETFAP13804 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ETFAP13804 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ETFAP13804 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ETFAP13804 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ETFAP13804 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ETFAP13804 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ETFAP13804 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ETFAP13804 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ETFAP13804 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ETFAP13804 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ETFAP13804 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ETFAP13804 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ETFAP13804 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ETFAP13804 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ETFAP13804 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ETFAP13804 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ETFAP13804 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ETFAP13804 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ETFAP13804 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ETFAP13804 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ETFAP13804 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ETFAP13804 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ETFAP13804 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ETFAP13804 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ETFAP13804 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ETFAP13804 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ETFAP13804 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ETFAP13804 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ETFAP13804 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms