Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GP1BBP13224 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GP1BBP13224 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GP1BBP13224 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GP1BBP13224 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GP1BBP13224 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GP1BBP13224 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GP1BBP13224 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GP1BBP13224 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GP1BBP13224 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GP1BBP13224 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GP1BBP13224 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GP1BBP13224 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GP1BBP13224 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GP1BBP13224 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GP1BBP13224 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GP1BBP13224 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GP1BBP13224 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GP1BBP13224 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GP1BBP13224 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GP1BBP13224 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GP1BBP13224 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GP1BBP13224 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GP1BBP13224 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GP1BBP13224 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GP1BBP13224 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GP1BBP13224 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GP1BBP13224 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GP1BBP13224 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GP1BBP13224 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GP1BBP13224 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GP1BBP13224 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GP1BBP13224 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GP1BBP13224 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GP1BBP13224 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GP1BBP13224 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GP1BBP13224 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GP1BBP13224 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GP1BBP13224 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
GP1BBP13224 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GP1BBP13224 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GP1BBP13224 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GP1BBP13224 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GP1BBP13224 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GP1BBP13224 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GP1BBP13224 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GP1BBP13224 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GP1BBP13224 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GP1BBP13224 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GP1BBP13224 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GP1BBP13224 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GP1BBP13224 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GP1BBP13224 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GP1BBP13224 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GP1BBP13224 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GP1BBP13224 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GP1BBP13224 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GP1BBP13224 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GP1BBP13224 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GP1BBP13224 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GP1BBP13224 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GP1BBP13224 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GP1BBP13224 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GP1BBP13224 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GP1BBP13224 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GP1BBP13224 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GP1BBP13224 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GP1BBP13224 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GP1BBP13224 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GP1BBP13224 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GP1BBP13224 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GP1BBP13224 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GP1BBP13224 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GP1BBP13224 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GP1BBP13224 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GP1BBP13224 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GP1BBP13224 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GP1BBP13224 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GP1BBP13224 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GP1BBP13224 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GP1BBP13224 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GP1BBP13224 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GP1BBP13224 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GP1BBP13224 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GP1BBP13224 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GP1BBP13224 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GP1BBP13224 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GP1BBP13224 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GP1BBP13224 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GP1BBP13224 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GP1BBP13224 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GP1BBP13224 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GP1BBP13224 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GP1BBP13224 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GP1BBP13224 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GP1BBP13224 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GP1BBP13224 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GP1BBP13224 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GP1BBP13224 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GP1BBP13224 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms