Protein–RNA interactions for Protein: P11217

PYGM, Glycogen phosphorylase, muscle form, humanhuman

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGMP11217 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PYGMP11217 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PYGMP11217 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PYGMP11217 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PYGMP11217 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PYGMP11217 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PYGMP11217 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PYGMP11217 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PYGMP11217 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PYGMP11217 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PYGMP11217 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PYGMP11217 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PYGMP11217 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PYGMP11217 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PYGMP11217 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PYGMP11217 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PYGMP11217 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PYGMP11217 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PYGMP11217 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PYGMP11217 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PYGMP11217 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PYGMP11217 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PYGMP11217 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PYGMP11217 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PYGMP11217 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PYGMP11217 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PYGMP11217 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PYGMP11217 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PYGMP11217 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PYGMP11217 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PYGMP11217 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PYGMP11217 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PYGMP11217 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PYGMP11217 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PYGMP11217 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PYGMP11217 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PYGMP11217 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
PYGMP11217 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PYGMP11217 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PYGMP11217 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PYGMP11217 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PYGMP11217 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PYGMP11217 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PYGMP11217 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PYGMP11217 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PYGMP11217 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PYGMP11217 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PYGMP11217 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PYGMP11217 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PYGMP11217 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PYGMP11217 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PYGMP11217 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PYGMP11217 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PYGMP11217 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PYGMP11217 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PYGMP11217 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PYGMP11217 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PYGMP11217 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PYGMP11217 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PYGMP11217 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PYGMP11217 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PYGMP11217 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PYGMP11217 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PYGMP11217 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PYGMP11217 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PYGMP11217 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PYGMP11217 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PYGMP11217 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PYGMP11217 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PYGMP11217 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PYGMP11217 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
PYGMP11217 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PYGMP11217 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PYGMP11217 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PYGMP11217 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PYGMP11217 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PYGMP11217 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PYGMP11217 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PYGMP11217 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PYGMP11217 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PYGMP11217 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PYGMP11217 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PYGMP11217 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PYGMP11217 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PYGMP11217 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PYGMP11217 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PYGMP11217 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PYGMP11217 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PYGMP11217 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PYGMP11217 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PYGMP11217 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PYGMP11217 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PYGMP11217 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PYGMP11217 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PYGMP11217 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PYGMP11217 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PYGMP11217 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PYGMP11217 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PYGMP11217 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PYGMP11217 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms