Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC192P0DO97 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC192P0DO97 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC192P0DO97 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CCDC192P0DO97 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC192P0DO97 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC192P0DO97 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC192P0DO97 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC192P0DO97 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC192P0DO97 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC192P0DO97 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC192P0DO97 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC192P0DO97 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC192P0DO97 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC192P0DO97 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC192P0DO97 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC192P0DO97 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC192P0DO97 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC192P0DO97 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC192P0DO97 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC192P0DO97 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC192P0DO97 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC192P0DO97 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC192P0DO97 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC192P0DO97 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC192P0DO97 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC192P0DO97 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC192P0DO97 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC192P0DO97 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CCDC192P0DO97 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC192P0DO97 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC192P0DO97 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC192P0DO97 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC192P0DO97 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC192P0DO97 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC192P0DO97 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC192P0DO97 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC192P0DO97 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC192P0DO97 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC192P0DO97 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC192P0DO97 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC192P0DO97 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC192P0DO97 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC192P0DO97 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC192P0DO97 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC192P0DO97 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC192P0DO97 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC192P0DO97 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC192P0DO97 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC192P0DO97 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC192P0DO97 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC192P0DO97 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC192P0DO97 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC192P0DO97 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC192P0DO97 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC192P0DO97 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC192P0DO97 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC192P0DO97 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC192P0DO97 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC192P0DO97 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC192P0DO97 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC192P0DO97 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC192P0DO97 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC192P0DO97 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC192P0DO97 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC192P0DO97 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC192P0DO97 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC192P0DO97 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC192P0DO97 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC192P0DO97 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC192P0DO97 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC192P0DO97 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC192P0DO97 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC192P0DO97 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC192P0DO97 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC192P0DO97 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC192P0DO97 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC192P0DO97 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC192P0DO97 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC192P0DO97 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC192P0DO97 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC192P0DO97 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC192P0DO97 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC192P0DO97 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC192P0DO97 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC192P0DO97 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC192P0DO97 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC192P0DO97 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC192P0DO97 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC192P0DO97 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC192P0DO97 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC192P0DO97 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC192P0DO97 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC192P0DO97 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC192P0DO97 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC192P0DO97 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC192P0DO97 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC192P0DO97 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC192P0DO97 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC192P0DO97 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms