Protein–RNA interactions for Protein: P08908

HTR1A, 5-hydroxytryptamine receptor 1A, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1AP08908 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTR1AP08908 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTR1AP08908 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTR1AP08908 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTR1AP08908 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTR1AP08908 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTR1AP08908 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTR1AP08908 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTR1AP08908 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTR1AP08908 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTR1AP08908 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTR1AP08908 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTR1AP08908 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTR1AP08908 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTR1AP08908 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTR1AP08908 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTR1AP08908 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTR1AP08908 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTR1AP08908 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTR1AP08908 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTR1AP08908 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTR1AP08908 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTR1AP08908 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTR1AP08908 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTR1AP08908 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTR1AP08908 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTR1AP08908 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTR1AP08908 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTR1AP08908 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTR1AP08908 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HTR1AP08908 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTR1AP08908 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTR1AP08908 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTR1AP08908 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTR1AP08908 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HTR1AP08908 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HTR1AP08908 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTR1AP08908 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTR1AP08908 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTR1AP08908 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTR1AP08908 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTR1AP08908 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTR1AP08908 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTR1AP08908 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTR1AP08908 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTR1AP08908 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HTR1AP08908 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTR1AP08908 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTR1AP08908 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTR1AP08908 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTR1AP08908 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTR1AP08908 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HTR1AP08908 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTR1AP08908 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTR1AP08908 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTR1AP08908 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTR1AP08908 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTR1AP08908 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTR1AP08908 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTR1AP08908 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTR1AP08908 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTR1AP08908 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTR1AP08908 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTR1AP08908 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTR1AP08908 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTR1AP08908 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTR1AP08908 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HTR1AP08908 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTR1AP08908 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTR1AP08908 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTR1AP08908 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTR1AP08908 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTR1AP08908 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTR1AP08908 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTR1AP08908 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTR1AP08908 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTR1AP08908 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HTR1AP08908 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTR1AP08908 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTR1AP08908 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTR1AP08908 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTR1AP08908 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTR1AP08908 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTR1AP08908 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR1AP08908 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR1AP08908 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR1AP08908 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR1AP08908 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR1AP08908 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR1AP08908 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR1AP08908 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR1AP08908 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTR1AP08908 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTR1AP08908 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTR1AP08908 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTR1AP08908 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTR1AP08908 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HTR1AP08908 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTR1AP08908 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTR1AP08908 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.8 ms