Protein–RNA interactions for Protein: P03999

OPN1SW, Short-wave-sensitive opsin 1, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN1SWP03999 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OPN1SWP03999 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OPN1SWP03999 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OPN1SWP03999 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OPN1SWP03999 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OPN1SWP03999 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
OPN1SWP03999 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OPN1SWP03999 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OPN1SWP03999 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OPN1SWP03999 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OPN1SWP03999 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OPN1SWP03999 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OPN1SWP03999 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OPN1SWP03999 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OPN1SWP03999 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OPN1SWP03999 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OPN1SWP03999 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OPN1SWP03999 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OPN1SWP03999 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OPN1SWP03999 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OPN1SWP03999 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OPN1SWP03999 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
OPN1SWP03999 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
OPN1SWP03999 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
OPN1SWP03999 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
OPN1SWP03999 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
OPN1SWP03999 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
OPN1SWP03999 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
OPN1SWP03999 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OPN1SWP03999 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OPN1SWP03999 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OPN1SWP03999 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OPN1SWP03999 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OPN1SWP03999 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OPN1SWP03999 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OPN1SWP03999 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OPN1SWP03999 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
OPN1SWP03999 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OPN1SWP03999 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
OPN1SWP03999 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OPN1SWP03999 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OPN1SWP03999 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OPN1SWP03999 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
OPN1SWP03999 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
OPN1SWP03999 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
OPN1SWP03999 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
OPN1SWP03999 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OPN1SWP03999 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OPN1SWP03999 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OPN1SWP03999 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OPN1SWP03999 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OPN1SWP03999 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
OPN1SWP03999 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OPN1SWP03999 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OPN1SWP03999 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OPN1SWP03999 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OPN1SWP03999 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OPN1SWP03999 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OPN1SWP03999 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OPN1SWP03999 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
OPN1SWP03999 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OPN1SWP03999 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OPN1SWP03999 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OPN1SWP03999 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
OPN1SWP03999 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
OPN1SWP03999 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OPN1SWP03999 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
OPN1SWP03999 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OPN1SWP03999 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
OPN1SWP03999 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
OPN1SWP03999 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
OPN1SWP03999 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OPN1SWP03999 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
OPN1SWP03999 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
OPN1SWP03999 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OPN1SWP03999 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OPN1SWP03999 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OPN1SWP03999 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
OPN1SWP03999 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OPN1SWP03999 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
OPN1SWP03999 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
OPN1SWP03999 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OPN1SWP03999 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OPN1SWP03999 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OPN1SWP03999 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
OPN1SWP03999 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OPN1SWP03999 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
OPN1SWP03999 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OPN1SWP03999 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
OPN1SWP03999 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
OPN1SWP03999 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
OPN1SWP03999 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OPN1SWP03999 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OPN1SWP03999 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OPN1SWP03999 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OPN1SWP03999 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OPN1SWP03999 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
OPN1SWP03999 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OPN1SWP03999 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
OPN1SWP03999 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96 ms