Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFNB1P01574 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFNB1P01574 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFNB1P01574 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFNB1P01574 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFNB1P01574 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFNB1P01574 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFNB1P01574 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFNB1P01574 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFNB1P01574 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IFNB1P01574 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IFNB1P01574 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
IFNB1P01574 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
IFNB1P01574 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFNB1P01574 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFNB1P01574 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFNB1P01574 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFNB1P01574 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFNB1P01574 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFNB1P01574 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFNB1P01574 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFNB1P01574 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFNB1P01574 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFNB1P01574 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IFNB1P01574 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IFNB1P01574 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IFNB1P01574 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IFNB1P01574 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IFNB1P01574 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IFNB1P01574 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFNB1P01574 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFNB1P01574 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFNB1P01574 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
IFNB1P01574 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFNB1P01574 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFNB1P01574 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
IFNB1P01574 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFNB1P01574 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFNB1P01574 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
IFNB1P01574 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
IFNB1P01574 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFNB1P01574 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFNB1P01574 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFNB1P01574 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFNB1P01574 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFNB1P01574 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFNB1P01574 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFNB1P01574 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFNB1P01574 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFNB1P01574 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFNB1P01574 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFNB1P01574 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFNB1P01574 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFNB1P01574 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFNB1P01574 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFNB1P01574 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IFNB1P01574 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IFNB1P01574 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IFNB1P01574 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IFNB1P01574 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFNB1P01574 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
IFNB1P01574 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFNB1P01574 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFNB1P01574 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFNB1P01574 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFNB1P01574 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
IFNB1P01574 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFNB1P01574 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFNB1P01574 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFNB1P01574 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFNB1P01574 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFNB1P01574 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFNB1P01574 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFNB1P01574 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFNB1P01574 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFNB1P01574 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFNB1P01574 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFNB1P01574 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFNB1P01574 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
IFNB1P01574 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFNB1P01574 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFNB1P01574 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFNB1P01574 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFNB1P01574 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFNB1P01574 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFNB1P01574 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFNB1P01574 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFNB1P01574 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFNB1P01574 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFNB1P01574 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFNB1P01574 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFNB1P01574 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFNB1P01574 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
IFNB1P01574 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
IFNB1P01574 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFNB1P01574 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFNB1P01574 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFNB1P01574 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFNB1P01574 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFNB1P01574 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms