Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MSCO60682 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MSCO60682 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MSCO60682 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MSCO60682 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MSCO60682 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MSCO60682 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MSCO60682 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MSCO60682 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MSCO60682 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MSCO60682 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MSCO60682 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MSCO60682 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MSCO60682 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MSCO60682 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MSCO60682 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MSCO60682 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MSCO60682 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MSCO60682 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MSCO60682 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
MSCO60682 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MSCO60682 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MSCO60682 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MSCO60682 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MSCO60682 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MSCO60682 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MSCO60682 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MSCO60682 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MSCO60682 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MSCO60682 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MSCO60682 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MSCO60682 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
MSCO60682 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MSCO60682 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
MSCO60682 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MSCO60682 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MSCO60682 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MSCO60682 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MSCO60682 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MSCO60682 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MSCO60682 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MSCO60682 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MSCO60682 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MSCO60682 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MSCO60682 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
MSCO60682 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MSCO60682 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MSCO60682 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MSCO60682 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MSCO60682 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MSCO60682 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MSCO60682 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MSCO60682 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
MSCO60682 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MSCO60682 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MSCO60682 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MSCO60682 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MSCO60682 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MSCO60682 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MSCO60682 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MSCO60682 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MSCO60682 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MSCO60682 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MSCO60682 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MSCO60682 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MSCO60682 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MSCO60682 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MSCO60682 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MSCO60682 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MSCO60682 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MSCO60682 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MSCO60682 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MSCO60682 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MSCO60682 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MSCO60682 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MSCO60682 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MSCO60682 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MSCO60682 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MSCO60682 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MSCO60682 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MSCO60682 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MSCO60682 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MSCO60682 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MSCO60682 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
MSCO60682 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MSCO60682 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MSCO60682 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MSCO60682 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MSCO60682 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MSCO60682 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MSCO60682 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MSCO60682 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
MSCO60682 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MSCO60682 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MSCO60682 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MSCO60682 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MSCO60682 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MSCO60682 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MSCO60682 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MSCO60682 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms