Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PLIN1O60240 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PLIN1O60240 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PLIN1O60240 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PLIN1O60240 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PLIN1O60240 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PLIN1O60240 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PLIN1O60240 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PLIN1O60240 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PLIN1O60240 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PLIN1O60240 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PLIN1O60240 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PLIN1O60240 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PLIN1O60240 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PLIN1O60240 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PLIN1O60240 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PLIN1O60240 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PLIN1O60240 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PLIN1O60240 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PLIN1O60240 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PLIN1O60240 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PLIN1O60240 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PLIN1O60240 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PLIN1O60240 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PLIN1O60240 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
PLIN1O60240 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PLIN1O60240 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PLIN1O60240 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PLIN1O60240 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PLIN1O60240 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PLIN1O60240 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PLIN1O60240 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
PLIN1O60240 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PLIN1O60240 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PLIN1O60240 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PLIN1O60240 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PLIN1O60240 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PLIN1O60240 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PLIN1O60240 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PLIN1O60240 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PLIN1O60240 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PLIN1O60240 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PLIN1O60240 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PLIN1O60240 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PLIN1O60240 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PLIN1O60240 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
PLIN1O60240 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PLIN1O60240 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PLIN1O60240 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PLIN1O60240 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PLIN1O60240 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PLIN1O60240 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PLIN1O60240 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PLIN1O60240 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PLIN1O60240 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PLIN1O60240 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PLIN1O60240 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PLIN1O60240 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PLIN1O60240 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PLIN1O60240 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PLIN1O60240 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
PLIN1O60240 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PLIN1O60240 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PLIN1O60240 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PLIN1O60240 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PLIN1O60240 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PLIN1O60240 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PLIN1O60240 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
PLIN1O60240 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
PLIN1O60240 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
PLIN1O60240 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PLIN1O60240 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PLIN1O60240 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PLIN1O60240 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PLIN1O60240 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PLIN1O60240 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PLIN1O60240 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PLIN1O60240 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PLIN1O60240 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
PLIN1O60240 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PLIN1O60240 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PLIN1O60240 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PLIN1O60240 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PLIN1O60240 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
PLIN1O60240 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PLIN1O60240 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PLIN1O60240 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
PLIN1O60240 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PLIN1O60240 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PLIN1O60240 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PLIN1O60240 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PLIN1O60240 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
PLIN1O60240 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC31.39■■■□□ 2.62
PLIN1O60240 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PLIN1O60240 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PLIN1O60240 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PLIN1O60240 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PLIN1O60240 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PLIN1O60240 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PLIN1O60240 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms