Protein–RNA interactions for Protein: O43896

KIF1C, Kinesin-like protein KIF1C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF1CO43896 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIF1CO43896 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIF1CO43896 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIF1CO43896 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIF1CO43896 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIF1CO43896 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIF1CO43896 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIF1CO43896 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIF1CO43896 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIF1CO43896 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIF1CO43896 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KIF1CO43896 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIF1CO43896 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIF1CO43896 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIF1CO43896 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KIF1CO43896 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KIF1CO43896 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KIF1CO43896 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KIF1CO43896 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KIF1CO43896 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KIF1CO43896 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIF1CO43896 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIF1CO43896 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIF1CO43896 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIF1CO43896 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIF1CO43896 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIF1CO43896 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIF1CO43896 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIF1CO43896 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIF1CO43896 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIF1CO43896 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KIF1CO43896 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KIF1CO43896 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
KIF1CO43896 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KIF1CO43896 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KIF1CO43896 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KIF1CO43896 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KIF1CO43896 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KIF1CO43896 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KIF1CO43896 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIF1CO43896 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIF1CO43896 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIF1CO43896 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIF1CO43896 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIF1CO43896 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIF1CO43896 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIF1CO43896 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIF1CO43896 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIF1CO43896 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIF1CO43896 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIF1CO43896 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIF1CO43896 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIF1CO43896 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIF1CO43896 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIF1CO43896 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIF1CO43896 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KIF1CO43896 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KIF1CO43896 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KIF1CO43896 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KIF1CO43896 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KIF1CO43896 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KIF1CO43896 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KIF1CO43896 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KIF1CO43896 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KIF1CO43896 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF1CO43896 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF1CO43896 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF1CO43896 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIF1CO43896 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIF1CO43896 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIF1CO43896 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIF1CO43896 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIF1CO43896 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIF1CO43896 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIF1CO43896 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIF1CO43896 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIF1CO43896 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIF1CO43896 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIF1CO43896 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIF1CO43896 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIF1CO43896 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIF1CO43896 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIF1CO43896 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIF1CO43896 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIF1CO43896 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIF1CO43896 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIF1CO43896 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIF1CO43896 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIF1CO43896 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIF1CO43896 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIF1CO43896 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIF1CO43896 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIF1CO43896 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIF1CO43896 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIF1CO43896 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIF1CO43896 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIF1CO43896 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIF1CO43896 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIF1CO43896 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIF1CO43896 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms