Protein–RNA interactions for Protein: H3BU86

STX16-NPEPL1, STX16-NPEPL1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX16-NPEPL1H3BU86 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
STX16-NPEPL1H3BU86 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
STX16-NPEPL1H3BU86 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
STX16-NPEPL1H3BU86 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
STX16-NPEPL1H3BU86 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
STX16-NPEPL1H3BU86 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
STX16-NPEPL1H3BU86 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
STX16-NPEPL1H3BU86 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
STX16-NPEPL1H3BU86 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
STX16-NPEPL1H3BU86 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
STX16-NPEPL1H3BU86 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
STX16-NPEPL1H3BU86 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
STX16-NPEPL1H3BU86 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
STX16-NPEPL1H3BU86 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
STX16-NPEPL1H3BU86 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
STX16-NPEPL1H3BU86 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
STX16-NPEPL1H3BU86 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
STX16-NPEPL1H3BU86 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
STX16-NPEPL1H3BU86 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
STX16-NPEPL1H3BU86 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
STX16-NPEPL1H3BU86 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
STX16-NPEPL1H3BU86 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
STX16-NPEPL1H3BU86 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
STX16-NPEPL1H3BU86 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
STX16-NPEPL1H3BU86 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
STX16-NPEPL1H3BU86 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
STX16-NPEPL1H3BU86 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
STX16-NPEPL1H3BU86 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
STX16-NPEPL1H3BU86 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
STX16-NPEPL1H3BU86 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
STX16-NPEPL1H3BU86 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
STX16-NPEPL1H3BU86 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
STX16-NPEPL1H3BU86 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
STX16-NPEPL1H3BU86 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
STX16-NPEPL1H3BU86 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
STX16-NPEPL1H3BU86 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
STX16-NPEPL1H3BU86 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
STX16-NPEPL1H3BU86 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
STX16-NPEPL1H3BU86 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
STX16-NPEPL1H3BU86 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
STX16-NPEPL1H3BU86 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
STX16-NPEPL1H3BU86 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
STX16-NPEPL1H3BU86 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
STX16-NPEPL1H3BU86 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
STX16-NPEPL1H3BU86 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
STX16-NPEPL1H3BU86 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
STX16-NPEPL1H3BU86 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
STX16-NPEPL1H3BU86 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
STX16-NPEPL1H3BU86 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
STX16-NPEPL1H3BU86 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
STX16-NPEPL1H3BU86 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
STX16-NPEPL1H3BU86 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
STX16-NPEPL1H3BU86 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
STX16-NPEPL1H3BU86 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
STX16-NPEPL1H3BU86 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
STX16-NPEPL1H3BU86 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
STX16-NPEPL1H3BU86 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
STX16-NPEPL1H3BU86 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
STX16-NPEPL1H3BU86 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
STX16-NPEPL1H3BU86 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
STX16-NPEPL1H3BU86 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
STX16-NPEPL1H3BU86 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
STX16-NPEPL1H3BU86 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
STX16-NPEPL1H3BU86 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
STX16-NPEPL1H3BU86 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
STX16-NPEPL1H3BU86 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
STX16-NPEPL1H3BU86 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
STX16-NPEPL1H3BU86 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
STX16-NPEPL1H3BU86 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
STX16-NPEPL1H3BU86 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
STX16-NPEPL1H3BU86 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
STX16-NPEPL1H3BU86 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
STX16-NPEPL1H3BU86 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
STX16-NPEPL1H3BU86 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
STX16-NPEPL1H3BU86 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
STX16-NPEPL1H3BU86 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
STX16-NPEPL1H3BU86 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
STX16-NPEPL1H3BU86 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
STX16-NPEPL1H3BU86 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
STX16-NPEPL1H3BU86 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
STX16-NPEPL1H3BU86 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
STX16-NPEPL1H3BU86 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
STX16-NPEPL1H3BU86 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
STX16-NPEPL1H3BU86 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STX16-NPEPL1H3BU86 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STX16-NPEPL1H3BU86 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STX16-NPEPL1H3BU86 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STX16-NPEPL1H3BU86 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STX16-NPEPL1H3BU86 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STX16-NPEPL1H3BU86 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STX16-NPEPL1H3BU86 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STX16-NPEPL1H3BU86 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STX16-NPEPL1H3BU86 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
STX16-NPEPL1H3BU86 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
STX16-NPEPL1H3BU86 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
STX16-NPEPL1H3BU86 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
STX16-NPEPL1H3BU86 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
STX16-NPEPL1H3BU86 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
STX16-NPEPL1H3BU86 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
STX16-NPEPL1H3BU86 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms