Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF879B4DU55 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF879B4DU55 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF879B4DU55 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF879B4DU55 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF879B4DU55 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF879B4DU55 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF879B4DU55 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF879B4DU55 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF879B4DU55 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF879B4DU55 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF879B4DU55 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF879B4DU55 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF879B4DU55 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF879B4DU55 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF879B4DU55 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF879B4DU55 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF879B4DU55 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF879B4DU55 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF879B4DU55 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF879B4DU55 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF879B4DU55 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF879B4DU55 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF879B4DU55 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF879B4DU55 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF879B4DU55 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF879B4DU55 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF879B4DU55 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF879B4DU55 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF879B4DU55 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF879B4DU55 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF879B4DU55 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF879B4DU55 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF879B4DU55 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF879B4DU55 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF879B4DU55 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF879B4DU55 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF879B4DU55 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF879B4DU55 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF879B4DU55 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF879B4DU55 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF879B4DU55 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF879B4DU55 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF879B4DU55 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF879B4DU55 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF879B4DU55 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF879B4DU55 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF879B4DU55 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF879B4DU55 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF879B4DU55 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF879B4DU55 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF879B4DU55 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF879B4DU55 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF879B4DU55 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF879B4DU55 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF879B4DU55 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF879B4DU55 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF879B4DU55 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF879B4DU55 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF879B4DU55 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF879B4DU55 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF879B4DU55 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF879B4DU55 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF879B4DU55 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF879B4DU55 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF879B4DU55 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF879B4DU55 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF879B4DU55 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF879B4DU55 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF879B4DU55 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF879B4DU55 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF879B4DU55 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF879B4DU55 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF879B4DU55 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF879B4DU55 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF879B4DU55 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF879B4DU55 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF879B4DU55 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF879B4DU55 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF879B4DU55 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF879B4DU55 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF879B4DU55 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF879B4DU55 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF879B4DU55 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF879B4DU55 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF879B4DU55 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF879B4DU55 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF879B4DU55 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF879B4DU55 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF879B4DU55 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF879B4DU55 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF879B4DU55 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF879B4DU55 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF879B4DU55 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF879B4DU55 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF879B4DU55 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF879B4DU55 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF879B4DU55 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF879B4DU55 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF879B4DU55 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms