Protein–RNA interactions for Protein: A8MT33

SYCE1L, Synaptonemal complex central element protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE1LA8MT33 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCE1LA8MT33 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCE1LA8MT33 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCE1LA8MT33 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCE1LA8MT33 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCE1LA8MT33 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCE1LA8MT33 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCE1LA8MT33 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCE1LA8MT33 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCE1LA8MT33 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCE1LA8MT33 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCE1LA8MT33 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCE1LA8MT33 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCE1LA8MT33 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYCE1LA8MT33 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYCE1LA8MT33 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYCE1LA8MT33 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYCE1LA8MT33 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYCE1LA8MT33 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYCE1LA8MT33 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SYCE1LA8MT33 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYCE1LA8MT33 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYCE1LA8MT33 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYCE1LA8MT33 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYCE1LA8MT33 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYCE1LA8MT33 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYCE1LA8MT33 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SYCE1LA8MT33 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYCE1LA8MT33 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYCE1LA8MT33 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCE1LA8MT33 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCE1LA8MT33 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCE1LA8MT33 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCE1LA8MT33 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCE1LA8MT33 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCE1LA8MT33 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCE1LA8MT33 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCE1LA8MT33 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCE1LA8MT33 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYCE1LA8MT33 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYCE1LA8MT33 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYCE1LA8MT33 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYCE1LA8MT33 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYCE1LA8MT33 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SYCE1LA8MT33 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYCE1LA8MT33 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYCE1LA8MT33 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYCE1LA8MT33 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYCE1LA8MT33 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYCE1LA8MT33 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYCE1LA8MT33 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYCE1LA8MT33 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYCE1LA8MT33 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYCE1LA8MT33 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SYCE1LA8MT33 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYCE1LA8MT33 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYCE1LA8MT33 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYCE1LA8MT33 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYCE1LA8MT33 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYCE1LA8MT33 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYCE1LA8MT33 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYCE1LA8MT33 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYCE1LA8MT33 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYCE1LA8MT33 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYCE1LA8MT33 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SYCE1LA8MT33 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYCE1LA8MT33 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYCE1LA8MT33 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYCE1LA8MT33 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYCE1LA8MT33 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYCE1LA8MT33 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYCE1LA8MT33 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYCE1LA8MT33 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYCE1LA8MT33 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYCE1LA8MT33 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYCE1LA8MT33 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYCE1LA8MT33 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYCE1LA8MT33 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYCE1LA8MT33 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYCE1LA8MT33 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYCE1LA8MT33 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYCE1LA8MT33 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYCE1LA8MT33 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYCE1LA8MT33 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYCE1LA8MT33 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYCE1LA8MT33 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYCE1LA8MT33 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYCE1LA8MT33 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYCE1LA8MT33 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYCE1LA8MT33 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYCE1LA8MT33 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYCE1LA8MT33 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCE1LA8MT33 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCE1LA8MT33 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCE1LA8MT33 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCE1LA8MT33 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYCE1LA8MT33 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYCE1LA8MT33 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYCE1LA8MT33 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYCE1LA8MT33 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms