Protein–RNA interactions for Protein: A6NMK7

CPSF4L, Putative cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 4-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF4LA6NMK7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CPSF4LA6NMK7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CPSF4LA6NMK7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPSF4LA6NMK7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPSF4LA6NMK7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPSF4LA6NMK7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPSF4LA6NMK7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPSF4LA6NMK7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPSF4LA6NMK7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPSF4LA6NMK7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPSF4LA6NMK7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPSF4LA6NMK7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPSF4LA6NMK7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPSF4LA6NMK7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPSF4LA6NMK7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPSF4LA6NMK7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CPSF4LA6NMK7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPSF4LA6NMK7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPSF4LA6NMK7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPSF4LA6NMK7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPSF4LA6NMK7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPSF4LA6NMK7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPSF4LA6NMK7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPSF4LA6NMK7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPSF4LA6NMK7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPSF4LA6NMK7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPSF4LA6NMK7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CPSF4LA6NMK7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPSF4LA6NMK7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CPSF4LA6NMK7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPSF4LA6NMK7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPSF4LA6NMK7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPSF4LA6NMK7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPSF4LA6NMK7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPSF4LA6NMK7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPSF4LA6NMK7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPSF4LA6NMK7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CPSF4LA6NMK7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPSF4LA6NMK7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPSF4LA6NMK7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPSF4LA6NMK7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPSF4LA6NMK7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CPSF4LA6NMK7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPSF4LA6NMK7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPSF4LA6NMK7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPSF4LA6NMK7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CPSF4LA6NMK7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CPSF4LA6NMK7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPSF4LA6NMK7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPSF4LA6NMK7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPSF4LA6NMK7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPSF4LA6NMK7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPSF4LA6NMK7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPSF4LA6NMK7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPSF4LA6NMK7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPSF4LA6NMK7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPSF4LA6NMK7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPSF4LA6NMK7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPSF4LA6NMK7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CPSF4LA6NMK7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPSF4LA6NMK7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPSF4LA6NMK7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPSF4LA6NMK7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPSF4LA6NMK7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPSF4LA6NMK7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPSF4LA6NMK7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPSF4LA6NMK7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPSF4LA6NMK7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPSF4LA6NMK7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPSF4LA6NMK7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPSF4LA6NMK7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPSF4LA6NMK7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPSF4LA6NMK7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CPSF4LA6NMK7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPSF4LA6NMK7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPSF4LA6NMK7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPSF4LA6NMK7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CPSF4LA6NMK7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPSF4LA6NMK7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CPSF4LA6NMK7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CPSF4LA6NMK7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPSF4LA6NMK7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPSF4LA6NMK7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPSF4LA6NMK7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPSF4LA6NMK7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPSF4LA6NMK7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPSF4LA6NMK7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPSF4LA6NMK7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPSF4LA6NMK7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPSF4LA6NMK7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPSF4LA6NMK7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPSF4LA6NMK7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPSF4LA6NMK7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPSF4LA6NMK7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPSF4LA6NMK7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPSF4LA6NMK7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPSF4LA6NMK7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPSF4LA6NMK7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPSF4LA6NMK7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPSF4LA6NMK7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.1 ms