Protein–RNA interactions for Protein: A6NH52

TVP23A, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23AA6NH52 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TVP23AA6NH52 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TVP23AA6NH52 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TVP23AA6NH52 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TVP23AA6NH52 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TVP23AA6NH52 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TVP23AA6NH52 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TVP23AA6NH52 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TVP23AA6NH52 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TVP23AA6NH52 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TVP23AA6NH52 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TVP23AA6NH52 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TVP23AA6NH52 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TVP23AA6NH52 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TVP23AA6NH52 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TVP23AA6NH52 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TVP23AA6NH52 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TVP23AA6NH52 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TVP23AA6NH52 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TVP23AA6NH52 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TVP23AA6NH52 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TVP23AA6NH52 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TVP23AA6NH52 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TVP23AA6NH52 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TVP23AA6NH52 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TVP23AA6NH52 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TVP23AA6NH52 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TVP23AA6NH52 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TVP23AA6NH52 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TVP23AA6NH52 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TVP23AA6NH52 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TVP23AA6NH52 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TVP23AA6NH52 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TVP23AA6NH52 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TVP23AA6NH52 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TVP23AA6NH52 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TVP23AA6NH52 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TVP23AA6NH52 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TVP23AA6NH52 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TVP23AA6NH52 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TVP23AA6NH52 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TVP23AA6NH52 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TVP23AA6NH52 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TVP23AA6NH52 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TVP23AA6NH52 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TVP23AA6NH52 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TVP23AA6NH52 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TVP23AA6NH52 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TVP23AA6NH52 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TVP23AA6NH52 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TVP23AA6NH52 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TVP23AA6NH52 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TVP23AA6NH52 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TVP23AA6NH52 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TVP23AA6NH52 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TVP23AA6NH52 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TVP23AA6NH52 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TVP23AA6NH52 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TVP23AA6NH52 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TVP23AA6NH52 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TVP23AA6NH52 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TVP23AA6NH52 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TVP23AA6NH52 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TVP23AA6NH52 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TVP23AA6NH52 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TVP23AA6NH52 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TVP23AA6NH52 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TVP23AA6NH52 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TVP23AA6NH52 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TVP23AA6NH52 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TVP23AA6NH52 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TVP23AA6NH52 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TVP23AA6NH52 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TVP23AA6NH52 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TVP23AA6NH52 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TVP23AA6NH52 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TVP23AA6NH52 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TVP23AA6NH52 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TVP23AA6NH52 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TVP23AA6NH52 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TVP23AA6NH52 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TVP23AA6NH52 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TVP23AA6NH52 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TVP23AA6NH52 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TVP23AA6NH52 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TVP23AA6NH52 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TVP23AA6NH52 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TVP23AA6NH52 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TVP23AA6NH52 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TVP23AA6NH52 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TVP23AA6NH52 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TVP23AA6NH52 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TVP23AA6NH52 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TVP23AA6NH52 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TVP23AA6NH52 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TVP23AA6NH52 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TVP23AA6NH52 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TVP23AA6NH52 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TVP23AA6NH52 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TVP23AA6NH52 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms