Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GMNCA6NCL1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GMNCA6NCL1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GMNCA6NCL1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GMNCA6NCL1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GMNCA6NCL1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GMNCA6NCL1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GMNCA6NCL1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GMNCA6NCL1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GMNCA6NCL1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GMNCA6NCL1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GMNCA6NCL1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GMNCA6NCL1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GMNCA6NCL1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GMNCA6NCL1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GMNCA6NCL1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GMNCA6NCL1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GMNCA6NCL1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GMNCA6NCL1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GMNCA6NCL1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GMNCA6NCL1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GMNCA6NCL1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GMNCA6NCL1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GMNCA6NCL1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GMNCA6NCL1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GMNCA6NCL1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GMNCA6NCL1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GMNCA6NCL1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GMNCA6NCL1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GMNCA6NCL1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GMNCA6NCL1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GMNCA6NCL1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GMNCA6NCL1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GMNCA6NCL1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GMNCA6NCL1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GMNCA6NCL1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GMNCA6NCL1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GMNCA6NCL1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GMNCA6NCL1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GMNCA6NCL1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GMNCA6NCL1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GMNCA6NCL1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GMNCA6NCL1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GMNCA6NCL1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GMNCA6NCL1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GMNCA6NCL1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GMNCA6NCL1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GMNCA6NCL1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GMNCA6NCL1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GMNCA6NCL1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GMNCA6NCL1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GMNCA6NCL1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GMNCA6NCL1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GMNCA6NCL1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GMNCA6NCL1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GMNCA6NCL1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GMNCA6NCL1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GMNCA6NCL1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GMNCA6NCL1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GMNCA6NCL1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GMNCA6NCL1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GMNCA6NCL1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GMNCA6NCL1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GMNCA6NCL1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GMNCA6NCL1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GMNCA6NCL1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GMNCA6NCL1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GMNCA6NCL1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GMNCA6NCL1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GMNCA6NCL1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GMNCA6NCL1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GMNCA6NCL1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GMNCA6NCL1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GMNCA6NCL1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GMNCA6NCL1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GMNCA6NCL1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GMNCA6NCL1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GMNCA6NCL1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GMNCA6NCL1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GMNCA6NCL1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GMNCA6NCL1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GMNCA6NCL1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GMNCA6NCL1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GMNCA6NCL1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GMNCA6NCL1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GMNCA6NCL1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GMNCA6NCL1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GMNCA6NCL1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GMNCA6NCL1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GMNCA6NCL1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GMNCA6NCL1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GMNCA6NCL1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GMNCA6NCL1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GMNCA6NCL1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GMNCA6NCL1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GMNCA6NCL1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GMNCA6NCL1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GMNCA6NCL1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GMNCA6NCL1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GMNCA6NCL1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms