Protein–RNA interactions for Protein: A0A539

TCRBV7S3A2, T-cell receptor beta variable 4-2 (Fragment), humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV7S3A2A0A539 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCRBV7S3A2A0A539 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCRBV7S3A2A0A539 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCRBV7S3A2A0A539 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCRBV7S3A2A0A539 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCRBV7S3A2A0A539 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCRBV7S3A2A0A539 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCRBV7S3A2A0A539 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCRBV7S3A2A0A539 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCRBV7S3A2A0A539 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TCRBV7S3A2A0A539 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TCRBV7S3A2A0A539 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCRBV7S3A2A0A539 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCRBV7S3A2A0A539 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCRBV7S3A2A0A539 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCRBV7S3A2A0A539 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCRBV7S3A2A0A539 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCRBV7S3A2A0A539 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TCRBV7S3A2A0A539 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCRBV7S3A2A0A539 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCRBV7S3A2A0A539 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TCRBV7S3A2A0A539 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TCRBV7S3A2A0A539 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCRBV7S3A2A0A539 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCRBV7S3A2A0A539 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCRBV7S3A2A0A539 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCRBV7S3A2A0A539 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCRBV7S3A2A0A539 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCRBV7S3A2A0A539 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCRBV7S3A2A0A539 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCRBV7S3A2A0A539 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCRBV7S3A2A0A539 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCRBV7S3A2A0A539 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCRBV7S3A2A0A539 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCRBV7S3A2A0A539 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCRBV7S3A2A0A539 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCRBV7S3A2A0A539 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCRBV7S3A2A0A539 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCRBV7S3A2A0A539 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCRBV7S3A2A0A539 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCRBV7S3A2A0A539 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCRBV7S3A2A0A539 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCRBV7S3A2A0A539 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCRBV7S3A2A0A539 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCRBV7S3A2A0A539 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCRBV7S3A2A0A539 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCRBV7S3A2A0A539 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCRBV7S3A2A0A539 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TCRBV7S3A2A0A539 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCRBV7S3A2A0A539 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCRBV7S3A2A0A539 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCRBV7S3A2A0A539 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCRBV7S3A2A0A539 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCRBV7S3A2A0A539 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCRBV7S3A2A0A539 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCRBV7S3A2A0A539 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCRBV7S3A2A0A539 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCRBV7S3A2A0A539 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCRBV7S3A2A0A539 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCRBV7S3A2A0A539 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCRBV7S3A2A0A539 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCRBV7S3A2A0A539 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCRBV7S3A2A0A539 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCRBV7S3A2A0A539 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCRBV7S3A2A0A539 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCRBV7S3A2A0A539 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCRBV7S3A2A0A539 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TCRBV7S3A2A0A539 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TCRBV7S3A2A0A539 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCRBV7S3A2A0A539 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCRBV7S3A2A0A539 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCRBV7S3A2A0A539 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCRBV7S3A2A0A539 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCRBV7S3A2A0A539 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCRBV7S3A2A0A539 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCRBV7S3A2A0A539 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCRBV7S3A2A0A539 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCRBV7S3A2A0A539 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCRBV7S3A2A0A539 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCRBV7S3A2A0A539 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCRBV7S3A2A0A539 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCRBV7S3A2A0A539 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCRBV7S3A2A0A539 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCRBV7S3A2A0A539 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCRBV7S3A2A0A539 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCRBV7S3A2A0A539 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCRBV7S3A2A0A539 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCRBV7S3A2A0A539 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCRBV7S3A2A0A539 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCRBV7S3A2A0A539 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCRBV7S3A2A0A539 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCRBV7S3A2A0A539 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCRBV7S3A2A0A539 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCRBV7S3A2A0A539 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCRBV7S3A2A0A539 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCRBV7S3A2A0A539 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCRBV7S3A2A0A539 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCRBV7S3A2A0A539 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCRBV7S3A2A0A539 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCRBV7S3A2A0A539 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
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