Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PARP3Q9Y6F1 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
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