Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms