Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms