Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW5

AGTPBP1, Cytosolic carboxypeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGTPBP1Q9UPW5 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AGTPBP1Q9UPW5 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AGTPBP1Q9UPW5 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AGTPBP1Q9UPW5 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
AGTPBP1Q9UPW5 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AGTPBP1Q9UPW5 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AGTPBP1Q9UPW5 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AGTPBP1Q9UPW5 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AGTPBP1Q9UPW5 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AGTPBP1Q9UPW5 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AGTPBP1Q9UPW5 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AGTPBP1Q9UPW5 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AGTPBP1Q9UPW5 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AGTPBP1Q9UPW5 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AGTPBP1Q9UPW5 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AGTPBP1Q9UPW5 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AGTPBP1Q9UPW5 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AGTPBP1Q9UPW5 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AGTPBP1Q9UPW5 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGTPBP1Q9UPW5 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGTPBP1Q9UPW5 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGTPBP1Q9UPW5 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGTPBP1Q9UPW5 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGTPBP1Q9UPW5 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGTPBP1Q9UPW5 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGTPBP1Q9UPW5 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGTPBP1Q9UPW5 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGTPBP1Q9UPW5 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGTPBP1Q9UPW5 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGTPBP1Q9UPW5 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
AGTPBP1Q9UPW5 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGTPBP1Q9UPW5 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGTPBP1Q9UPW5 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGTPBP1Q9UPW5 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGTPBP1Q9UPW5 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGTPBP1Q9UPW5 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
AGTPBP1Q9UPW5 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGTPBP1Q9UPW5 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGTPBP1Q9UPW5 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGTPBP1Q9UPW5 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGTPBP1Q9UPW5 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGTPBP1Q9UPW5 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGTPBP1Q9UPW5 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGTPBP1Q9UPW5 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGTPBP1Q9UPW5 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGTPBP1Q9UPW5 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGTPBP1Q9UPW5 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
AGTPBP1Q9UPW5 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
AGTPBP1Q9UPW5 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
AGTPBP1Q9UPW5 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
AGTPBP1Q9UPW5 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AGTPBP1Q9UPW5 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AGTPBP1Q9UPW5 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AGTPBP1Q9UPW5 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AGTPBP1Q9UPW5 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
AGTPBP1Q9UPW5 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AGTPBP1Q9UPW5 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AGTPBP1Q9UPW5 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AGTPBP1Q9UPW5 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AGTPBP1Q9UPW5 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
AGTPBP1Q9UPW5 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AGTPBP1Q9UPW5 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
AGTPBP1Q9UPW5 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
AGTPBP1Q9UPW5 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AGTPBP1Q9UPW5 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AGTPBP1Q9UPW5 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AGTPBP1Q9UPW5 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AGTPBP1Q9UPW5 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AGTPBP1Q9UPW5 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AGTPBP1Q9UPW5 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AGTPBP1Q9UPW5 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AGTPBP1Q9UPW5 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AGTPBP1Q9UPW5 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AGTPBP1Q9UPW5 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AGTPBP1Q9UPW5 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AGTPBP1Q9UPW5 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AGTPBP1Q9UPW5 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AGTPBP1Q9UPW5 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AGTPBP1Q9UPW5 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AGTPBP1Q9UPW5 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AGTPBP1Q9UPW5 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AGTPBP1Q9UPW5 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
AGTPBP1Q9UPW5 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AGTPBP1Q9UPW5 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AGTPBP1Q9UPW5 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AGTPBP1Q9UPW5 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AGTPBP1Q9UPW5 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AGTPBP1Q9UPW5 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AGTPBP1Q9UPW5 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AGTPBP1Q9UPW5 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AGTPBP1Q9UPW5 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AGTPBP1Q9UPW5 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AGTPBP1Q9UPW5 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AGTPBP1Q9UPW5 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AGTPBP1Q9UPW5 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms