Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SETD1BQ9UPS6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SETD1BQ9UPS6 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SETD1BQ9UPS6 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SETD1BQ9UPS6 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SETD1BQ9UPS6 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SETD1BQ9UPS6 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SETD1BQ9UPS6 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SETD1BQ9UPS6 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SETD1BQ9UPS6 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SETD1BQ9UPS6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SETD1BQ9UPS6 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SETD1BQ9UPS6 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SETD1BQ9UPS6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SETD1BQ9UPS6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SETD1BQ9UPS6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SETD1BQ9UPS6 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SETD1BQ9UPS6 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SETD1BQ9UPS6 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SETD1BQ9UPS6 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SETD1BQ9UPS6 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SETD1BQ9UPS6 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SETD1BQ9UPS6 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SETD1BQ9UPS6 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SETD1BQ9UPS6 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SETD1BQ9UPS6 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SETD1BQ9UPS6 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SETD1BQ9UPS6 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SETD1BQ9UPS6 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SETD1BQ9UPS6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SETD1BQ9UPS6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SETD1BQ9UPS6 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SETD1BQ9UPS6 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SETD1BQ9UPS6 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SETD1BQ9UPS6 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SETD1BQ9UPS6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SETD1BQ9UPS6 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SETD1BQ9UPS6 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SETD1BQ9UPS6 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SETD1BQ9UPS6 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SETD1BQ9UPS6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SETD1BQ9UPS6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SETD1BQ9UPS6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SETD1BQ9UPS6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SETD1BQ9UPS6 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SETD1BQ9UPS6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SETD1BQ9UPS6 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SETD1BQ9UPS6 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SETD1BQ9UPS6 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SETD1BQ9UPS6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SETD1BQ9UPS6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SETD1BQ9UPS6 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SETD1BQ9UPS6 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SETD1BQ9UPS6 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SETD1BQ9UPS6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SETD1BQ9UPS6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SETD1BQ9UPS6 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SETD1BQ9UPS6 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SETD1BQ9UPS6 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SETD1BQ9UPS6 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SETD1BQ9UPS6 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SETD1BQ9UPS6 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SETD1BQ9UPS6 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SETD1BQ9UPS6 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SETD1BQ9UPS6 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SETD1BQ9UPS6 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SETD1BQ9UPS6 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SETD1BQ9UPS6 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SETD1BQ9UPS6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SETD1BQ9UPS6 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SETD1BQ9UPS6 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SETD1BQ9UPS6 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms