Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms