Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms