Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL8

PHF11, PHD finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF11Q9UIL8 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms