Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms