Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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