Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
DKK3Q9UBP4 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms