Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRPC4Q9UBN4 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms